125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1179 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  69.33 
 
 		 528 aa  788    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  97.24 
 
 		 543 aa  1107    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  71.96 
 
 		 525 aa  813    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  98.16 
 
 		 543 aa  1120    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  100 
 
 		 543 aa  1139    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  96.87 
 
 		 543 aa  1106    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  52.35 
 
 		 514 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  49.53 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  49.26 
 
 		 520 aa  532  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  49.82 
 
 		 524 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  48.23 
 
 		 524 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  47.13 
 
 		 522 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  48.42 
 
 		 526 aa  521  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  47.84 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  46.04 
 
 		 537 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  46.1 
 
 		 517 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  46.14 
 
 		 508 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  45.57 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  45.96 
 
 		 531 aa  472  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  45.85 
 
 		 505 aa  465  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  43.75 
 
 		 518 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  44.34 
 
 		 527 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  42.33 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  41.37 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  40.04 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  40.04 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  39.66 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  39.55 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  38.62 
 
 		 522 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  39.66 
 
 		 507 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  38.26 
 
 		 532 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  37.87 
 
 		 507 aa  360  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  36.87 
 
 		 508 aa  359  8e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  37.08 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  36.8 
 
 		 508 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  37.31 
 
 		 507 aa  349  7e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  37.6 
 
 		 507 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  36.38 
 
 		 507 aa  345  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  35.98 
 
 		 515 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  36.29 
 
 		 510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  36.42 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  36.01 
 
 		 537 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  33.75 
 
 		 501 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 499 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 501 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.37 
 
 		 508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  34.05 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.86 
 
 		 498 aa  239  8e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  33.67 
 
 		 515 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 517 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 499 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.18 
 
 		 508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  31.33 
 
 		 504 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31.17 
 
 		 505 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  32.59 
 
 		 497 aa  230  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  31.93 
 
 		 512 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 507 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  31.9 
 
 		 502 aa  226  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  31.55 
 
 		 492 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  30.02 
 
 		 503 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  32.25 
 
 		 501 aa  223  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  32.88 
 
 		 509 aa  223  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  27.17 
 
 		 529 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  29.06 
 
 		 529 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  28.7 
 
 		 538 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.38 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.3 
 
 		 505 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  30.02 
 
 		 511 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  31.53 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  29.46 
 
 		 496 aa  213  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  29.05 
 
 		 496 aa  213  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  29.72 
 
 		 497 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  31.95 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.61 
 
 		 506 aa  210  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  27.92 
 
 		 538 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  28.05 
 
 		 538 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  27.92 
 
 		 538 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  29.21 
 
 		 506 aa  206  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  30.28 
 
 		 506 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  27.55 
 
 		 538 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  30.39 
 
 		 494 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  31.48 
 
 		 503 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  29.76 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  31.02 
 
 		 497 aa  203  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  30.19 
 
 		 523 aa  203  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  31.77 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  31.42 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  28.55 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  28.84 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  27.37 
 
 		 538 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  32.26 
 
 		 499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  31.2 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  31.03 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  29.1 
 
 		 740 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  30.28 
 
 		 504 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  28.44 
 
 		 503 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  28.44 
 
 		 503 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  31.03 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>