253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0141 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  100 
 
 
255 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  99.61 
 
 
255 aa  530  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  100 
 
 
255 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  98.82 
 
 
255 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  94.12 
 
 
255 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  92.94 
 
 
255 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  92.94 
 
 
255 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  91.76 
 
 
255 aa  488  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  92.13 
 
 
255 aa  485  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  61.8 
 
 
267 aa  344  7e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  62.69 
 
 
264 aa  344  7e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  59.85 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  58.02 
 
 
267 aa  317  9e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  57.47 
 
 
263 aa  314  8e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  55.29 
 
 
257 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  52.55 
 
 
261 aa  275  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  48.85 
 
 
266 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  42.8 
 
 
269 aa  222  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  43.18 
 
 
268 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  40.38 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  43.28 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  39.26 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
273 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
273 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  33.09 
 
 
280 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  33.58 
 
 
271 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  36.24 
 
 
294 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  36.8 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 
279 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  34.7 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  37.37 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  37.28 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  36.59 
 
 
277 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  31.5 
 
 
278 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
285 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
285 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  35.94 
 
 
283 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  32.86 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  35.94 
 
 
283 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  36.92 
 
 
285 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  34.59 
 
 
283 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 
294 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  32.51 
 
 
309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  28.51 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  25.85 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  44.88 
 
 
159 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  29.81 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  27.65 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  25.94 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  25.42 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.27 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  27.27 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.53 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.53 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  28.96 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  28.37 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  26.89 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.55 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  26.89 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  26.94 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  26.34 
 
 
251 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.2 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  27.88 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  24.63 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  24.63 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  27.88 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  29.65 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.57 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  26.44 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  27.4 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  27.4 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  26.92 
 
 
272 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  27.89 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  25.67 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  26.03 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  25.96 
 
 
272 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  25.48 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  25.63 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  25.35 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
260 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  25 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1864  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.35 
 
 
153 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.804482  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.29 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  25.59 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 
277 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.74 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>