More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  50.29 
 
 		 952 aa  975    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0515  molydopterin dinucleotide-binding region  51.63 
 
 		 964 aa  951    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.470196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  45.18 
 
 		 1018 aa  822    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22740  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  40.64 
 
 		 1053 aa  718    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.945653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  45.21 
 
 		 1002 aa  828    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.3924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06120  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  39.72 
 
 		 1003 aa  669    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0471  molydopterin dinucleotide-binding region  82.01 
 
 		 1017 aa  1748    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  100 
 
 		 1023 aa  2128    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0501  molydopterin dinucleotide-binding region  43.43 
 
 		 1032 aa  804    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.638156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0497  molydopterin dinucleotide-binding region  44.42 
 
 		 1102 aa  430  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3031  molydopterin dinucleotide-binding region  39.97 
 
 		 1193 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  26.11 
 
 		 971 aa  233  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 		 803 aa  197  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  31.32 
 
 		 777 aa  193  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  30.46 
 
 		 776 aa  193  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  30.95 
 
 		 744 aa  191  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  25.9 
 
 		 803 aa  189  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  27.65 
 
 		 781 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  28.65 
 
 		 755 aa  183  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  28.68 
 
 		 747 aa  178  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  27.45 
 
 		 747 aa  174  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  28.99 
 
 		 756 aa  170  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  28.75 
 
 		 794 aa  168  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.39 
 
 		 698 aa  166  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  32.8 
 
 		 945 aa  158  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  28.62 
 
 		 753 aa  157  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  34.05 
 
 		 910 aa  155  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  32.71 
 
 		 898 aa  155  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  27.94 
 
 		 745 aa  155  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  26.74 
 
 		 739 aa  154  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 		 791 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  27.99 
 
 		 1148 aa  148  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  31.93 
 
 		 942 aa  147  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 		 817 aa  145  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  25.79 
 
 		 711 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 		 729 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  33.2 
 
 		 807 aa  137  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  26.13 
 
 		 1139 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  25.73 
 
 		 1135 aa  137  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  26.08 
 
 		 1143 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  26.62 
 
 		 726 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  31.94 
 
 		 759 aa  132  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  29.9 
 
 		 734 aa  131  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  30.45 
 
 		 856 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.88 
 
 		 979 aa  127  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  27.61 
 
 		 789 aa  127  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  25.65 
 
 		 1138 aa  126  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  30.33 
 
 		 730 aa  124  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  32.33 
 
 		 791 aa  120  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  28.42 
 
 		 843 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  29.59 
 
 		 1055 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  28.48 
 
 		 817 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  31.5 
 
 		 731 aa  119  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  23.07 
 
 		 961 aa  119  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  30.61 
 
 		 700 aa  118  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  31.01 
 
 		 1155 aa  117  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  30.13 
 
 		 947 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.48 
 
 		 722 aa  117  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  28.73 
 
 		 891 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  31.44 
 
 		 765 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  30.08 
 
 		 820 aa  115  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  22.55 
 
 		 917 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2584  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  23.92 
 
 		 927 aa  115  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.822778  normal  0.769168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 		 760 aa  115  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 		 866 aa  114  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  32.82 
 
 		 1142 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.77 
 
 		 764 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.77 
 
 		 764 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 		 764 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  26.12 
 
 		 760 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  28.94 
 
 		 784 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  29.22 
 
 		 818 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  26.8 
 
 		 758 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 		 760 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  26.8 
 
 		 758 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  26.8 
 
 		 758 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  29.03 
 
 		 750 aa  110  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  26.8 
 
 		 758 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  23.25 
 
 		 927 aa  109  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  27.88 
 
 		 911 aa  109  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.99 
 
 		 744 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  30.27 
 
 		 731 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  25.43 
 
 		 764 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1404  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  28.09 
 
 		 790 aa  108  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  25.43 
 
 		 764 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  24.77 
 
 		 749 aa  108  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  28.2 
 
 		 805 aa  108  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  26.46 
 
 		 758 aa  108  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  22.58 
 
 		 928 aa  108  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.33 
 
 		 739 aa  107  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 		 805 aa  107  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  25.71 
 
 		 836 aa  107  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 		 812 aa  107  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  29 
 
 		 781 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  26.78 
 
 		 741 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 		 739 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1175  molydopterin dinucleotide-binding region  26.44 
 
 		 962 aa  105  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000509072  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.28 
 
 		 760 aa  105  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.58 
 
 		 826 aa  104  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  27.64 
 
 		 821 aa  104  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>