More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16640 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  555  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0593  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.98 
 
 		 126 aa  105  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.723259 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  29.89 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  29.83 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0192  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.44 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 105 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  40.71 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2275  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.05 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0578  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.48 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 119 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  32.31 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3407  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.24 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0286119 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1864  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.27 
 
 		 126 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 94 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  44.09 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.05 
 
 		 130 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 103 aa  64.3  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.45 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1391  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018666  unclonable  0.00000780162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  42.65 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.49 
 
 		 115 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.49 
 
 		 115 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  43.84 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  35.14 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  34.52 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  39.71 
 
 		 113 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 103 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 100 aa  58.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 103 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 115 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  34.83 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  43.84 
 
 		 99 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  36.49 
 
 		 93 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 111 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 104 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 94 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 107 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 115 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 		 97 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 85 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 107 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 116 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  34.88 
 
 		 107 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 107 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 103 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  41.54 
 
 		 94 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  41.54 
 
 		 94 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  39.44 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 107 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 107 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  35 
 
 		 112 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 100 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 		 98 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  36.7 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  38.55 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  35.23 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>