47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1864 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1864  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
126 aa  256  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3407  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  56.1 
 
 
127 aa  147  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0286119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2275  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  56.1 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0578  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.28 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333668  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0593  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.38 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.22 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  38.52 
 
 
236 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  36.27 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0192  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.06 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.4 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.23 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1950  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  31.9 
 
 
125 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.75 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.71 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  32.14 
 
 
248 aa  56.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2026  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.96 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.880915  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.58 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2429  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  40.24 
 
 
119 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2159  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.36 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1457  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.81 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.443694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1076  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  23.08 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.230109  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2820  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.33 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1411  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.14 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000170326  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.85 
 
 
419 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3595  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.13 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.501304  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  30.19 
 
 
244 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1693  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.11 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1324  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.14 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  29.25 
 
 
244 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.88 
 
 
471 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0907  hypothetical protein  25.86 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.603611  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.27 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  34.41 
 
 
415 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2420  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1147  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.83 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0637681  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0600  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.32 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1088  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.91 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000294077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0746  hypothetical protein  30.53 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1986  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.22 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  27.96 
 
 
416 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0393  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.43 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0581  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.43 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1005  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  23.21 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0097254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1101  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  23.21 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.4 
 
 
439 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2282  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.47 
 
 
132 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.344508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>