46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0578 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0578  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
127 aa  253  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2275  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  50 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3407  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  49.21 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0286119 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0593  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.3 
 
 
126 aa  116  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723259 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1864  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.28 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  36.97 
 
 
236 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.5 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0192  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.75 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  32.48 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.77 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0907  hypothetical protein  30.08 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.603611  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.19 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.23 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  27.35 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.63 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1457  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  26.83 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.443694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1076  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.41 
 
 
122 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.230109  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2820  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.79 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2159  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.19 
 
 
117 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1324  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.2 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.28 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1101  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.55 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1005  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.55 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0097254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.48 
 
 
153 aa  51.2  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  33.64 
 
 
248 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  30.08 
 
 
244 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2429  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.04 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2026  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.64 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.880915  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  30.08 
 
 
244 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1341  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.03 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000188114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1411  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.44 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000170326  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2220  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.93 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1693  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.91 
 
 
112 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0367  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.3 
 
 
157 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0600  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.88 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0656  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  25.6 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000343998  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2028  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.19 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000280293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2737  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.86 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1283  hypothetical protein  27.91 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00697466  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1553  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.62 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000698293  decreased coverage  0.0000195705 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2420  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.08 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1867  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  31.11 
 
 
416 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1986  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.33 
 
 
471 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.55 
 
 
439 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>