120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1863 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  100 
 
 
236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2278  protein of unknown function DUF134  38.57 
 
 
230 aa  144  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_195  DNA-binding protein  56.12 
 
 
117 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0322712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0135  hypothetical protein  55.1 
 
 
117 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0218  DNA-binding protein, putative  56.12 
 
 
117 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.597835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1957  hypothetical protein  53.4 
 
 
138 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2275  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  46.34 
 
 
125 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1340  hypothetical protein  51.09 
 
 
132 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1655  hypothetical protein  54 
 
 
149 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00120133  hitchhiker  0.00648564 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2417  protein of unknown function DUF134  52.08 
 
 
115 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0090  hypothetical protein  54.35 
 
 
153 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1249  protein of unknown function DUF134  53.85 
 
 
155 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.928642  normal  0.573446 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1343  protein of unknown function DUF134  53.85 
 
 
157 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1147  hypothetical protein  50.5 
 
 
113 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0233  protein of unknown function DUF134  53.26 
 
 
154 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3407  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.9 
 
 
127 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0286119 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1003  hypothetical protein  42.57 
 
 
153 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1194  hypothetical protein  53.68 
 
 
143 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1402  protein of unknown function DUF134  57.61 
 
 
143 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1487  protein of unknown function DUF134  50.55 
 
 
157 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0241794  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0578  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.97 
 
 
127 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333668  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1458  hypothetical protein  46 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.53934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1864  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.52 
 
 
126 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0906  hypothetical protein  50 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18270  predicted DNA-binding protein  50 
 
 
135 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1427  protein of unknown function DUF134  48.89 
 
 
153 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2281  protein of unknown function DUF134  51.09 
 
 
140 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.479687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2142  hypothetical protein  52.22 
 
 
107 aa  86.3  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0727  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0886  hypothetical protein  50.55 
 
 
177 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.799321  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2090  DNA-binding proteins-like protein  48.91 
 
 
130 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000200078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1128  hypothetical protein  46.9 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0501  hypothetical protein  49.43 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0881  protein of unknown function DUF134  44 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.451175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0435  HTH DNA-binding protein  48.24 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1146  protein of unknown function DUF134  46 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143872  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0635  hypothetical protein  48.89 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0593  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.54 
 
 
126 aa  82  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723259 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1492  hypothetical protein  42.55 
 
 
130 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0753  hypothetical protein  44.83 
 
 
91 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3699  hypothetical protein  48.31 
 
 
98 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0192  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.29 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3913  hypothetical protein  49.43 
 
 
96 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0656  hypothetical protein  48.31 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0627  protein of unknown function DUF134  40.82 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0686  hypothetical protein  48.31 
 
 
98 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2279  protein of unknown function DUF134  50 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2819  hypothetical protein  48.31 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000685  HTH DNA-binding protein  49.43 
 
 
96 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3639  hypothetical protein  47.13 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0197  protein of unknown function DUF134  49.41 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1642  hypothetical protein  42.55 
 
 
130 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.176572  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0687  hypothetical protein  44.94 
 
 
98 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0263195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.82 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2571  protein of unknown function DUF134  26.82 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  32.31 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0986  hypothetical protein  41.49 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0214647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0272  hypothetical protein  41.49 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.185869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2217  hypothetical protein  42.39 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1150  hypothetical protein  35.58 
 
 
201 aa  72  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0587  hypothetical protein  42.53 
 
 
93 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3434  protein of unknown function DUF134  43.68 
 
 
94 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1391  hypothetical protein  43.68 
 
 
93 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1428  hypothetical protein  43.68 
 
 
93 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814064  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1410  hypothetical protein  46.24 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1981  protein of unknown function DUF134  39.13 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.427185  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.04 
 
 
123 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0830  hypothetical protein  55.56 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125088  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  30.77 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.9 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3018  hypothetical protein  44.57 
 
 
132 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000905593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2602  protein of unknown function DUF134  46.32 
 
 
103 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000947411  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.2 
 
 
126 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0556  hypothetical protein  48.68 
 
 
127 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.186851  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.48 
 
 
119 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0933  protein of unknown function DUF134  37.8 
 
 
103 aa  58.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  29.51 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  28.69 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2345  protein of unknown function DUF134  39.02 
 
 
119 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0907  hypothetical protein  31.9 
 
 
122 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.603611  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1411  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.84 
 
 
120 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000170326  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2161  HTH DNA-binding protein  40 
 
 
119 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.78 
 
 
130 aa  53.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2435  hypothetical protein  51.67 
 
 
125 aa  52.4  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337978  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0048  hypothetical protein  43.96 
 
 
98 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1076  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.02 
 
 
122 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.230109  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1529  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.14 
 
 
116 aa  52  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2075  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.58 
 
 
126 aa  49.3  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1947  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.04 
 
 
135 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0840414  hitchhiker  0.0000000000000241959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1088  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.56 
 
 
127 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000294077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  33.7 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2420  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.66 
 
 
109 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0204  protein of unknown function DUF134  40 
 
 
95 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1457  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.12 
 
 
122 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.443694  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2421  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.32 
 
 
115 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2159  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.08 
 
 
117 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.96 
 
 
127 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000101949  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1553  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.27 
 
 
122 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000698293  decreased coverage  0.0000195705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2026  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  40 
 
 
118 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.880915  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1974  putative DNA-binding protein  36.11 
 
 
72 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>