66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1974 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1974  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 72 aa  146  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1391  hypothetical protein  62.12 
 
 		 93 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3434  protein of unknown function DUF134  61.19 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1428  hypothetical protein  62.12 
 
 		 93 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0587  hypothetical protein  59.09 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0753  hypothetical protein  48.44 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000685  HTH DNA-binding protein  50 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0048  hypothetical protein  58.46 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3913  hypothetical protein  48.48 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0501  hypothetical protein  44.44 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3639  hypothetical protein  51.61 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0135  hypothetical protein  46.03 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2142  hypothetical protein  49.21 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0881  protein of unknown function DUF134  50 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.451175  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_195  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0322712  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1458  hypothetical protein  48.28 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.53934  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1146  protein of unknown function DUF134  42.86 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143872  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0218  DNA-binding protein, putative  46.03 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.597835  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2819  hypothetical protein  44.07 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0933  protein of unknown function DUF134  45.45 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0906  hypothetical protein  44.44 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2345  protein of unknown function DUF134  46.43 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0435  HTH DNA-binding protein  46.55 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1249  protein of unknown function DUF134  39.68 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.928642  normal  0.573446 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0556  hypothetical protein  44.26 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.186851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0727  hypothetical protein  49.09 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2435  hypothetical protein  48.28 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0635  hypothetical protein  39.34 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1655  hypothetical protein  39.68 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00120133  hitchhiker  0.00648564 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1492  hypothetical protein  43.1 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3699  hypothetical protein  43.08 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0986  hypothetical protein  44.83 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0214647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1642  hypothetical protein  44.83 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.176572  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0272  hypothetical protein  44.83 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.185869  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0342  hypothetical protein  36.92 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0144063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0656  hypothetical protein  46.43 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2161  HTH DNA-binding protein  44.83 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1763  hypothetical protein  37.1 
 
 		 116 aa  50.8  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0886  hypothetical protein  39.68 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.799321  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0686  hypothetical protein  46.43 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0730  hypothetical protein  40.62 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.736425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0627  protein of unknown function DUF134  37.31 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0687  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0263195  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1427  protein of unknown function DUF134  38.1 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0090  hypothetical protein  36.51 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1402  protein of unknown function DUF134  39.34 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1410  hypothetical protein  41.43 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1003  hypothetical protein  35.62 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0233  protein of unknown function DUF134  33.33 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1487  protein of unknown function DUF134  36.51 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0241794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1147  hypothetical protein  36.51 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2279  protein of unknown function DUF134  44.64 
 
 		 192 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3018  hypothetical protein  39.68 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000905593  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2417  protein of unknown function DUF134  40 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2217  hypothetical protein  37.93 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2090  DNA-binding proteins-like protein  33.33 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000200078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2281  protein of unknown function DUF134  38.1 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.479687  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0830  hypothetical protein  39.06 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1981  protein of unknown function DUF134  33.87 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.427185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  36.11 
 
 		 236 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1343  protein of unknown function DUF134  36.51 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18270  predicted DNA-binding protein  38.71 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042916  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0204  protein of unknown function DUF134  36.21 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1194  hypothetical protein  32.81 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1957  hypothetical protein  32.26 
 
 		 138 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0197  protein of unknown function DUF134  33.33 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>