68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0342 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0342  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  259  6e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0144063  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2161  HTH DNA-binding protein  46.85 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2345  protein of unknown function DUF134  50 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2435  hypothetical protein  51.76 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337978  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0730  hypothetical protein  46.53 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.736425  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0933  protein of unknown function DUF134  47.76 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0556  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.186851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0435  HTH DNA-binding protein  47.46 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1763  hypothetical protein  47.54 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2142  hypothetical protein  40.28 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1249  protein of unknown function DUF134  44.59 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.928642  normal  0.573446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0635  hypothetical protein  38.89 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000685  HTH DNA-binding protein  36.11 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0627  protein of unknown function DUF134  34.65 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115018  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0886  hypothetical protein  38.36 
 
 
177 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.799321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1402  protein of unknown function DUF134  43.48 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0090  hypothetical protein  38.16 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0753  hypothetical protein  32.43 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1391  hypothetical protein  36.62 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1487  protein of unknown function DUF134  33.33 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0241794  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1428  hypothetical protein  36.62 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814064  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1974  putative DNA-binding protein  36.92 
 
 
72 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0727  hypothetical protein  33.77 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1427  protein of unknown function DUF134  41.25 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1655  hypothetical protein  40.58 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00120133  hitchhiker  0.00648564 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1642  hypothetical protein  35.21 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.176572  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3434  protein of unknown function DUF134  33.33 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1410  hypothetical protein  35.21 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0272  hypothetical protein  35.21 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.185869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0587  hypothetical protein  34.21 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1492  hypothetical protein  35.14 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2217  hypothetical protein  33.77 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0986  hypothetical protein  35.21 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0214647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0501  hypothetical protein  35.53 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0135  hypothetical protein  34.57 
 
 
117 aa  48.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3639  hypothetical protein  27.59 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2602  protein of unknown function DUF134  35.21 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000947411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1147  hypothetical protein  44.64 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0233  protein of unknown function DUF134  41.67 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1343  protein of unknown function DUF134  32.88 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3018  hypothetical protein  39.34 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000905593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2281  protein of unknown function DUF134  44.64 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.479687  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1003  hypothetical protein  38.36 
 
 
153 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0687  hypothetical protein  35.94 
 
 
98 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0263195  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2005  hypothetical protein  38.98 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.456089  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_195  DNA-binding protein  43.14 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0322712  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2030  protein of unknown function DUF134  44.78 
 
 
194 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2819  hypothetical protein  36.62 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0830  hypothetical protein  34.02 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125088  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1046  hypothetical protein  38.6 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442649  normal  0.956961 
 
 
-
 
NC_002936  DET0218  DNA-binding protein, putative  43.14 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.597835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3913  hypothetical protein  35 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1340  hypothetical protein  28.7 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0656  hypothetical protein  34.38 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1957  hypothetical protein  41.07 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18270  predicted DNA-binding protein  38.03 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0686  hypothetical protein  34.38 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3699  hypothetical protein  34.38 
 
 
98 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1146  protein of unknown function DUF134  30.14 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2090  DNA-binding proteins-like protein  37.14 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000200078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1981  protein of unknown function DUF134  31.94 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.427185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0197  protein of unknown function DUF134  27.78 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2278  protein of unknown function DUF134  34.78 
 
 
230 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0906  hypothetical protein  34.92 
 
 
203 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2417  protein of unknown function DUF134  39.22 
 
 
115 aa  40.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  31.88 
 
 
236 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1194  hypothetical protein  29.29 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1150  hypothetical protein  27.4 
 
 
201 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>