More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3250 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  47.58 
 
 		 828 aa  724    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  48.56 
 
 		 834 aa  772    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  100 
 
 		 831 aa  1676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  51.2 
 
 		 833 aa  821    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  29.24 
 
 		 904 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  29.24 
 
 		 904 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.27 
 
 		 904 aa  355  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  28.28 
 
 		 903 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.59 
 
 		 906 aa  290  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  26.27 
 
 		 962 aa  263  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  26.31 
 
 		 943 aa  260  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  26.34 
 
 		 1043 aa  246  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  27.92 
 
 		 1017 aa  239  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  24.67 
 
 		 882 aa  208  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.42 
 
 		 594 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  26.89 
 
 		 887 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  27.95 
 
 		 592 aa  165  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  27.19 
 
 		 637 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  27.99 
 
 		 588 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  26.85 
 
 		 602 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  26.03 
 
 		 598 aa  151  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  25.41 
 
 		 609 aa  151  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  28.01 
 
 		 632 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  28.46 
 
 		 611 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.03 
 
 		 634 aa  149  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  25.64 
 
 		 617 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  27.29 
 
 		 617 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  25.22 
 
 		 614 aa  146  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  28.03 
 
 		 623 aa  146  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  25.83 
 
 		 575 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.13 
 
 		 592 aa  146  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  27.43 
 
 		 632 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  29.58 
 
 		 867 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.94 
 
 		 609 aa  145  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.04 
 
 		 581 aa  145  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.24 
 
 		 577 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  30.3 
 
 		 861 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.94 
 
 		 591 aa  145  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  26.07 
 
 		 602 aa  145  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  28.28 
 
 		 628 aa  144  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  26.88 
 
 		 626 aa  144  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  24.23 
 
 		 618 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  25 
 
 		 870 aa  144  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  25.5 
 
 		 603 aa  144  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.97 
 
 		 618 aa  144  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  27.3 
 
 		 614 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  27.42 
 
 		 587 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  27.46 
 
 		 611 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  28.15 
 
 		 634 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.18 
 
 		 671 aa  143  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.57 
 
 		 586 aa  143  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  25.74 
 
 		 578 aa  142  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  26.11 
 
 		 588 aa  142  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  25.74 
 
 		 578 aa  142  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  25.83 
 
 		 616 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  25 
 
 		 663 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.15 
 
 		 596 aa  141  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05871  putative multidrug efflux ABC transporter  28.8 
 
 		 597 aa  141  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  27.63 
 
 		 600 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  27.18 
 
 		 636 aa  140  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  25.83 
 
 		 550 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  24.77 
 
 		 620 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  24.75 
 
 		 571 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.75 
 
 		 571 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  25 
 
 		 572 aa  140  8.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  24.66 
 
 		 595 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.35 
 
 		 598 aa  140  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  23.33 
 
 		 597 aa  140  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.92 
 
 		 1257 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.29 
 
 		 578 aa  139  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.75 
 
 		 571 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.5 
 
 		 603 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  24.93 
 
 		 597 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3548  ATPase  25.53 
 
 		 601 aa  139  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.82 
 
 		 586 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.38 
 
 		 602 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  24.69 
 
 		 586 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  27.7 
 
 		 610 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.09 
 
 		 579 aa  138  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  24.09 
 
 		 611 aa  138  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  27.07 
 
 		 578 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  24.64 
 
 		 556 aa  138  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.94 
 
 		 566 aa  138  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  25.58 
 
 		 649 aa  138  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  25.19 
 
 		 571 aa  138  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  25.2 
 
 		 580 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  25.19 
 
 		 614 aa  138  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  26.33 
 
 		 625 aa  138  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  25.97 
 
 		 607 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  24.53 
 
 		 597 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  26.79 
 
 		 615 aa  137  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  28.21 
 
 		 610 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.12 
 
 		 586 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.5 
 
 		 571 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.5 
 
 		 571 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.5 
 
 		 571 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.5 
 
 		 571 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  24.53 
 
 		 597 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.78 
 
 		 717 aa  137  8e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  27.7 
 
 		 592 aa  137  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>