More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2735 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  54.01 
 
 		 275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  58.82 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  57.2 
 
 		 272 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  56.81 
 
 		 272 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  54.94 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  55.73 
 
 		 268 aa  281  7.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  53.36 
 
 		 269 aa  281  8.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  52.51 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  52.9 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  58.61 
 
 		 273 aa  269  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  50.36 
 
 		 279 aa  265  7e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  52.99 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  49.22 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  50.96 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  55.89 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  48.55 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  46.07 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  46.07 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  45.69 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  47.62 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  52.19 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  51.28 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  50.74 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  51.7 
 
 		 275 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  50.19 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  49.81 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  51.7 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  50.56 
 
 		 281 aa  222  7e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  49.23 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  53.88 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  52.34 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  48.29 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  47.57 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  40.31 
 
 		 267 aa  192  7e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  43.37 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  38.01 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  44.31 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  33.57 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  39.76 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  36.33 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0698  ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  36.46 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  36.64 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.97 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.09 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  33.2 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.95 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  34.06 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.62 
 
 		 274 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  35.02 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  34.92 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  30.63 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  34.2 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  32.49 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.8 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  34.25 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  36.69 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  30.51 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  31.41 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  31.3 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  34.47 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.24 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  28.11 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.24 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  29.71 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.72 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  32 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  31.1 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.94 
 
 		 280 aa  125  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3807  ABC-3 protein  37.5 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  28.25 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  28.25 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  29.06 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  26.71 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  30.15 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  29.66 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  34.75 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  29.3 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  30.86 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.21 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  31.23 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  27.99 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 		 272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  28.9 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.33 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  28.9 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  31.76 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  31.46 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  28.35 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  29.55 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>