68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3476 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  80.14 
 
 		 2967 bp  1170    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  89.2 
 
 		 2967 bp  2746    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1575    89.14 
 
 		 1881 bp  2050    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  88.57 
 
 		 2967 bp  2621    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  89.14 
 
 		 2967 bp  2728    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  87.87 
 
 		 2967 bp  2476    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  84.28 
 
 		 2973 bp  1689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  89.51 
 
 		 2967 bp  2799    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  84.5 
 
 		 2973 bp  1746    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  84.28 
 
 		 2973 bp  1689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  84.37 
 
 		 2973 bp  1723    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  84.5 
 
 		 2973 bp  1746    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  84.5 
 
 		 2973 bp  1746    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  84.5 
 
 		 2973 bp  1746    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  87.62 
 
 		 2895 bp  2466    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3476    100 
 
 		 2978 bp  5903    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  89.51 
 
 		 2967 bp  2799    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  80.14 
 
 		 2967 bp  1170    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  80.79 
 
 		 2970 bp  868    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  89.06 
 
 		 2967 bp  3200    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  89.51 
 
 		 2967 bp  2799    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  90.33 
 
 		 2970 bp  2962    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  84.62 
 
 		 2268 bp  1669    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  89.51 
 
 		 2967 bp  2799    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  83.12 
 
 		 1581 bp  613  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6002    86.96 
 
 		 675 bp  593  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  90.41 
 
 		 1020 bp  573  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1297    90.41 
 
 		 1016 bp  573  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  88.87 
 
 		 795 bp  523  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  88.87 
 
 		 486 bp  513  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2295    81.86 
 
 		 1066 bp  478  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2143    88.24 
 
 		 444 bp  446  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  82.17 
 
 		 2967 bp  424  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  88.98 
 
 		 933 bp  412  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  88.98 
 
 		 2967 bp  412  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  88.98 
 
 		 768 bp  412  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  88.98 
 
 		 1821 bp  412  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  88.98 
 
 		 612 bp  412  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  81.9 
 
 		 2967 bp  408  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  81.9 
 
 		 2967 bp  408  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0157    89.04 
 
 		 1755 bp  406  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336177  normal  0.717019 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1040    81.89 
 
 		 1318 bp  369  3e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1409    88.22 
 
 		 765 bp  329  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  79.54 
 
 		 3048 bp  264  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1120    83.18 
 
 		 811 bp  208  7e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0916  hypothetical protein  88.37 
 
 		 336 bp  182  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15410    86.49 
 
 		 201 bp  135  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  9.49822e-18  unclonable  4.892999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  85.81 
 
 		 2967 bp  133  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  85.81 
 
 		 2967 bp  133  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  85.81 
 
 		 2967 bp  133  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  80.13 
 
 		 2958 bp  125  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0917    85.6 
 
 		 608 bp  105  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1039  hypothetical protein  90.14 
 
 		 93 bp  85.7  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1331  hypothetical protein  91.43 
 
 		 144 bp  83.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  84.62 
 
 		 822 bp  79.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1488  hypothetical protein  91.67 
 
 		 168 bp  79.8  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0200539  normal  0.398384 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4124  transposase Tn3  82.88 
 
 		 309 bp  69.9  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15420    81.68 
 
 		 165 bp  69.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.98117e-18  unclonable  4.51223e-22 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  87.93 
 
 		 2952 bp  60  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  91.11 
 
 		 2979 bp  58  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  91.11 
 
 		 2979 bp  58  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0844    96.77 
 
 		 249 bp  54  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  85.48 
 
 		 2589 bp  52  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  85.48 
 
 		 2985 bp  52  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  85.48 
 
 		 1653 bp  52  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  85.48 
 
 		 2985 bp  52  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  91.89 
 
 		 1641 bp  50.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  91.89 
 
 		 2886 bp  50.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>