93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2223 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 336 aa  684    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  71.73 
 
 		 335 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  63.39 
 
 		 336 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  63.99 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  63.1 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  62.91 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  60.42 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  62.61 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  62.2 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  62.31 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  62.61 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  59.94 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  62.3 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  56.01 
 
 		 341 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  54.55 
 
 		 342 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  54.01 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  44.01 
 
 		 344 aa  256  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 332 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.14 
 
 		 369 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  41.13 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  36.14 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  36.45 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  39.36 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  36.16 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.78 
 
 		 342 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  39.01 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  38.65 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  36.77 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  34.43 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  32.72 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.33 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  30.96 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  32.46 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  27.78 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.15 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.57 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  29.46 
 
 		 382 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  32.55 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  30.4 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  31.49 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.96 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.42 
 
 		 352 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  28 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  29 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.99 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.82 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  31.04 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  32.14 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  31.31 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  31.44 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.71 
 
 		 356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  31.32 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.32 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  28.57 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.29 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  28.79 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.35 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.35 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.35 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.27 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 397 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  25.18 
 
 		 897 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.79 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  26.13 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  27.43 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.22 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  34.44 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  24.41 
 
 		 742 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.32 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  21.95 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  29.81 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  23.47 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  26.86 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  22.3 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  24.22 
 
 		 421 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  29.65 
 
 		 329 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4449  hypothetical protein  36.92 
 
 		 408 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  24.89 
 
 		 661 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.33 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  39.19 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  32.65 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  24.43 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  35.06 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  35.06 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  22.37 
 
 		 1120 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  24.42 
 
 		 698 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  22.3 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.27 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  37.33 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  37.33 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  33.78 
 
 		 759 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  31.63 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>