More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1112 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  740    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  66.48 
 
 		 356 aa  478  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  65.33 
 
 		 360 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  64.47 
 
 		 362 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  65.9 
 
 		 377 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  63.04 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  62.75 
 
 		 363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  62.75 
 
 		 363 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  63.04 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  63.04 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  63.04 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  62.46 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  62.75 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  62.5 
 
 		 378 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  62.36 
 
 		 356 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  45.51 
 
 		 377 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  44.93 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  43.14 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  43.63 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  42.57 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  43.57 
 
 		 473 aa  280  3e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  41.23 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  43.15 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  40.91 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  40.99 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  44.21 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  40.92 
 
 		 360 aa  242  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  40.34 
 
 		 358 aa  229  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  39.29 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  37.57 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  40.29 
 
 		 358 aa  219  7.999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  37.97 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  39.43 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  32.32 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  34.39 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  31.88 
 
 		 345 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  29.91 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  31.05 
 
 		 347 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  27.38 
 
 		 353 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  28.9 
 
 		 464 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  28.37 
 
 		 464 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.22 
 
 		 422 aa  129  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  28.44 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  27.59 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.57 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  25.63 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  25.6 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  28.92 
 
 		 417 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  25.31 
 
 		 424 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0936  hypothetical protein  30 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0918  hypothetical protein  30 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  25.77 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  27.83 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  25.9 
 
 		 429 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  27.44 
 
 		 443 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  29.85 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  28.28 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  27.25 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  24.69 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  29.24 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  27.07 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  28.87 
 
 		 442 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  28.57 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  26.89 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  28.62 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  26.69 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  26.69 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  27.27 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  26.69 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  26.67 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  28.87 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  26.69 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  26.84 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  28.39 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  26.67 
 
 		 432 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  28.57 
 
 		 444 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2329  protein of unknown function DUF21  27.94 
 
 		 372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  25.82 
 
 		 444 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  26.98 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  26.65 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  24.92 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  25 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  26.75 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  27.36 
 
 		 456 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  26.69 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  27.4 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  26.51 
 
 		 451 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  24.16 
 
 		 420 aa  113  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  27.83 
 
 		 417 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  26.1 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  26.96 
 
 		 470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  28 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  28.08 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  28.39 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 		 427 aa  110  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0565  hemolysin-like protein  30.49 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000485397  hitchhiker  0.00159471 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  26.81 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  27 
 
 		 447 aa  109  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  27.3 
 
 		 418 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>