More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2459 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  72.77 
 
 		 483 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  100 
 
 		 483 aa  952    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  53.49 
 
 		 487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  48.12 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  47.76 
 
 		 491 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  44.92 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  50.22 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  49.34 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  42.35 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  50 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  52.49 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  42.98 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  42.23 
 
 		 490 aa  364  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  47.26 
 
 		 516 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  44.32 
 
 		 520 aa  358  9e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  44.32 
 
 		 520 aa  358  9e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  48.26 
 
 		 495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  45.45 
 
 		 540 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  45.01 
 
 		 531 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  47.78 
 
 		 533 aa  350  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  47.26 
 
 		 517 aa  350  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  39.88 
 
 		 660 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  41.1 
 
 		 502 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  41.83 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  45.26 
 
 		 509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  38.74 
 
 		 509 aa  332  7.000000000000001e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  49.3 
 
 		 502 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  40.83 
 
 		 607 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  39.38 
 
 		 522 aa  324  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  38.41 
 
 		 513 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  38.22 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  36.15 
 
 		 572 aa  273  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  40.23 
 
 		 467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  35.76 
 
 		 466 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  38.57 
 
 		 596 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  39.22 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  37.07 
 
 		 478 aa  256  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  36.8 
 
 		 468 aa  256  7e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  36.9 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  37.3 
 
 		 456 aa  240  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  37.23 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  35.14 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  36.9 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  36.12 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  32.89 
 
 		 487 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  36.26 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  38.5 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  32.83 
 
 		 466 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  33.33 
 
 		 466 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  32.83 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  32.83 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  34.51 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  33.69 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  33.69 
 
 		 467 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  33.26 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  33.26 
 
 		 466 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  32.85 
 
 		 465 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  35.55 
 
 		 474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  34.56 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  33.06 
 
 		 531 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  33.19 
 
 		 463 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  33.11 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  32.18 
 
 		 536 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  33.7 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  33.56 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  33.71 
 
 		 534 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  33.71 
 
 		 534 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  33.71 
 
 		 534 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  32.13 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  34.05 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  35.06 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  32.04 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  34.73 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  28.87 
 
 		 467 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  31.2 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  30.23 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  29.81 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  31.82 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.12 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  30.48 
 
 		 498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  31.69 
 
 		 472 aa  163  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  29.98 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  28.7 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  29.02 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  34.58 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  29.86 
 
 		 482 aa  150  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  27.68 
 
 		 474 aa  146  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  30.18 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  28.97 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  29.77 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  29.23 
 
 		 478 aa  140  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  29.43 
 
 		 449 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  27.82 
 
 		 570 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  29.68 
 
 		 491 aa  138  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.14 
 
 		 482 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  30.05 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.07 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  29.38 
 
 		 579 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  27.09 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.26 
 
 		 516 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>