49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2087 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  46.03 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1660  hypothetical protein  43.05 
 
 		 288 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0438  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  46.6 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000271356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  35.13 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.56 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  32.76 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  31.44 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  31.68 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  27.8 
 
 		 789 aa  90.1  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 630 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  37.14 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  35.09 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  27.43 
 
 		 631 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  30.22 
 
 		 640 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  27.94 
 
 		 673 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.73 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  26.54 
 
 		 704 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  26.41 
 
 		 670 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  32.63 
 
 		 712 aa  55.8  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0562  WD40 domain-containing protein  25.23 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.95 
 
 		 631 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.54 
 
 		 537 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  26.7 
 
 		 669 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.51 
 
 		 673 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  28.8 
 
 		 638 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  26.42 
 
 		 645 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  28.03 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  27.7 
 
 		 694 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  26.23 
 
 		 761 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  31.94 
 
 		 757 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  24.81 
 
 		 586 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.34 
 
 		 510 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  31.58 
 
 		 776 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 813 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  26.63 
 
 		 525 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  28.22 
 
 		 679 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  27.75 
 
 		 798 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  25.87 
 
 		 658 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  34.25 
 
 		 613 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  26.19 
 
 		 665 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 		 650 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  28.41 
 
 		 903 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  26.12 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  25 
 
 		 672 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  26.21 
 
 		 643 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  25.19 
 
 		 504 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  30.68 
 
 		 620 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  27.55 
 
 		 648 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>