35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0395 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  100 
 
 		 167 aa  344  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  96.39 
 
 		 167 aa  333  7e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0449  putative transcriptional regulator  78.26 
 
 		 171 aa  268  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0397  putative transcriptional regulator  68.79 
 
 		 167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3577  putative transcriptional regulator  67.52 
 
 		 167 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  65.45 
 
 		 167 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3628  putative transcriptional regulator  68.79 
 
 		 167 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000786438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  64.85 
 
 		 167 aa  229  9e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0396  putative transcriptional regulator  68.15 
 
 		 167 aa  229  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00892545  normal  0.277026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  64.85 
 
 		 167 aa  229  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  64.85 
 
 		 167 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  67.52 
 
 		 167 aa  227  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3244  putative transcriptional regulator  65.56 
 
 		 163 aa  224  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  42.47 
 
 		 656 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  42.47 
 
 		 656 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 663 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  43.26 
 
 		 643 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 622 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 504 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  39.35 
 
 		 543 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 		 515 aa  93.2  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 602 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 		 620 aa  64.3  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 		 620 aa  64.3  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 582 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 572 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.45 
 
 		 475 aa  44.3  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 		 641 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  28.78 
 
 		 458 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 606 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  25.61 
 
 		 628 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 687 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 499 aa  42  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  28.16 
 
 		 485 aa  41.2  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 413 aa  40.8  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>