38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2307 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  100 
 
 		 425 aa  869    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  45.3 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  41.9 
 
 		 421 aa  295  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  40.38 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  39.18 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  38.68 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  39.78 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  35.95 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  37.58 
 
 		 701 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  33.72 
 
 		 450 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  36.45 
 
 		 710 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  34.21 
 
 		 1031 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  32.98 
 
 		 467 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  29.38 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  30.14 
 
 		 682 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1011 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  30.46 
 
 		 770 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  30.11 
 
 		 772 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  31.09 
 
 		 566 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  30.09 
 
 		 670 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  30.2 
 
 		 593 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  26.59 
 
 		 541 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  27.91 
 
 		 819 aa  109  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  27.13 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  28 
 
 		 568 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  27.29 
 
 		 843 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  27.95 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  33.99 
 
 		 570 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  28.42 
 
 		 565 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  33.07 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1023 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  26.1 
 
 		 537 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  27.57 
 
 		 924 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  26.56 
 
 		 701 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  28.62 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  30.74 
 
 		 999 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.44 
 
 		 1063 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  41.27 
 
 		 314 aa  46.6  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>