125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1172 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  72.19 
 
 
507 aa  771    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  73.18 
 
 
507 aa  778    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  59.68 
 
 
508 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  61.42 
 
 
508 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  61.02 
 
 
508 aa  648    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  100 
 
 
507 aa  1058    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  56.09 
 
 
507 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  52.31 
 
 
507 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  53.07 
 
 
511 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  52.1 
 
 
510 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  51.49 
 
 
515 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  47.93 
 
 
537 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  46.5 
 
 
513 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  46.3 
 
 
513 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  46.5 
 
 
513 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  42.5 
 
 
526 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  43.13 
 
 
524 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  43.81 
 
 
524 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  43.1 
 
 
522 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  43.55 
 
 
508 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  41.39 
 
 
537 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  42.41 
 
 
514 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  41.59 
 
 
517 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  40.99 
 
 
518 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  41.47 
 
 
524 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  40.23 
 
 
514 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  41.49 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  40.66 
 
 
524 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  39.62 
 
 
528 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  40.55 
 
 
532 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  41.07 
 
 
520 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  39.07 
 
 
525 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  40.71 
 
 
527 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  39.85 
 
 
543 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  39.66 
 
 
543 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  38.98 
 
 
531 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  39.37 
 
 
543 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  39.85 
 
 
543 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  38.15 
 
 
517 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  37.3 
 
 
513 aa  362  9e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  39.03 
 
 
522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  38.03 
 
 
520 aa  349  7e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.55 
 
 
508 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.61 
 
 
505 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.35 
 
 
508 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.09 
 
 
492 aa  260  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  29.73 
 
 
529 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  29.92 
 
 
529 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  31.74 
 
 
538 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  31.74 
 
 
538 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  31.61 
 
 
538 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  31.74 
 
 
538 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  33.02 
 
 
507 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  34.38 
 
 
502 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  33.98 
 
 
538 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  31.95 
 
 
507 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  33.66 
 
 
504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  33.98 
 
 
538 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  33.81 
 
 
501 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  30.43 
 
 
498 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  33.73 
 
 
501 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  31.68 
 
 
497 aa  236  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  32.5 
 
 
496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.95 
 
 
517 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33.53 
 
 
499 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  30.83 
 
 
504 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  33.59 
 
 
502 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
499 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  31.98 
 
 
512 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  32.3 
 
 
497 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  31.03 
 
 
537 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  33.48 
 
 
515 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  31.76 
 
 
509 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  31.68 
 
 
501 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  31.25 
 
 
503 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  31.68 
 
 
506 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.85 
 
 
505 aa  224  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.95 
 
 
502 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  31.5 
 
 
511 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  31.76 
 
 
506 aa  223  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  30.77 
 
 
495 aa  223  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  32.24 
 
 
740 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  30.68 
 
 
500 aa  219  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  31.82 
 
 
510 aa  219  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  29.62 
 
 
523 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  30.81 
 
 
506 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  31.24 
 
 
501 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  31.54 
 
 
496 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  33.48 
 
 
498 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  30.14 
 
 
509 aa  216  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  30.75 
 
 
494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  30.1 
 
 
496 aa  214  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  31.39 
 
 
502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  28.83 
 
 
500 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  30.83 
 
 
497 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  30.68 
 
 
503 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  30.43 
 
 
503 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  29.5 
 
 
505 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  30.24 
 
 
503 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>