More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2836 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 132 aa  244  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  55.08 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  52.76 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  50.79 
 
 		 130 aa  103  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  49.18 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  56.52 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  50 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  51.24 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  48.76 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  54.64 
 
 		 127 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  50 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  58.7 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.94 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  44.63 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  46.28 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  50.41 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  48.03 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  47.46 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  41.8 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  51.89 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  51.24 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  61.11 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  42.98 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  48.25 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  34.92 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  34.92 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  47.46 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  47.46 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  42.86 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  44.21 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.96 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  42.24 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  42.71 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  45.65 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  48.98 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  36.59 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  40.48 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  43.68 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  50.55 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  36.21 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  42.71 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  37.17 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  43.69 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  43.14 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  35.85 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 		 154 aa  66.6  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  39.8 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  44.14 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1764  camphor resistance protein CrcB  52.94 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  38.21 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  45.26 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  33.06 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  38.14 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  40.98 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  37.8 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  41.76 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  46.53 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  42.61 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  42.37 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  42.55 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  41.46 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  48.65 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  41.32 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>