More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1897 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.98 
 
 
267 aa  310  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  52.24 
 
 
267 aa  239  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
263 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
263 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  46.24 
 
 
266 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  46.39 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  45.83 
 
 
264 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  45.25 
 
 
263 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 
263 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  44.74 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 
266 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
280 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  45.96 
 
 
263 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 
260 aa  208  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 
284 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
276 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
263 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
263 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
263 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
263 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
263 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
263 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
263 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
263 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  44.79 
 
 
261 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
262 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  48.86 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  49.05 
 
 
263 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  45.98 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 
263 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  45.15 
 
 
263 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
263 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
263 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 
264 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
263 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
263 aa  188  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
263 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  46.46 
 
 
261 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.23 
 
 
262 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  43.46 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
263 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
262 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 
262 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  39.16 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
264 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
263 aa  178  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
258 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
264 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.89 
 
 
265 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  45.99 
 
 
266 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 
263 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  46.24 
 
 
274 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
258 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 
251 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
259 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
258 aa  168  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
259 aa  168  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.44 
 
 
267 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 
260 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  43.77 
 
 
262 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
269 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
266 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.96 
 
 
272 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.77 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 
260 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  43.45 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
259 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 
263 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  43.07 
 
 
262 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
256 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 
258 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
261 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
263 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
257 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
266 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
259 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  46.39 
 
 
263 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
261 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
268 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
273 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
268 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4145  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
272 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4070  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
272 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
259 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
259 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>