More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2500 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  100 
 
 		 506 aa  1005    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  42.24 
 
 		 491 aa  106  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  41.51 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  39.27 
 
 		 306 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  40.74 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  40 
 
 		 433 aa  87.4  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  39.05 
 
 		 294 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  48.84 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  46.51 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  48.84 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6024  Peptidase M23  45.38 
 
 		 194 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  46.51 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  36.92 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  43.52 
 
 		 458 aa  76.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  38.64 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  48.15 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  44 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  48.1 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  39.67 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  48.65 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  43 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  42.86 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  38.1 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  39.68 
 
 		 680 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  45.68 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  46.84 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.67 
 
 		 321 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  46.91 
 
 		 690 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  32.68 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  40 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  48.65 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  45.45 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.42 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  38.02 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.84 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  38.02 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  43.96 
 
 		 433 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  48.65 
 
 		 438 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  36.29 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  47.3 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  45.68 
 
 		 692 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  43.96 
 
 		 433 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  38.02 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  43.96 
 
 		 433 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  40.4 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  50.68 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  43.96 
 
 		 433 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  47.3 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  38.02 
 
 		 421 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  44.44 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  44.44 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  48.65 
 
 		 438 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  38.02 
 
 		 412 aa  72  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  47.5 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  35.88 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  44.94 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  42.11 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  48.1 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  39.8 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  43.33 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  45.68 
 
 		 687 aa  70.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  44.59 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  42.86 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  44.05 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  43.37 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  42.71 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  45.74 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  42 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  42 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  38.89 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  42 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  42 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  42 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  45.95 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  46.43 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  36 
 
 		 676 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  43.16 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  42 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  45.24 
 
 		 681 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  45.88 
 
 		 538 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  42 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  43.9 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  42.22 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  41 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  38.05 
 
 		 265 aa  69.3  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  41 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  43.9 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  38.89 
 
 		 695 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  41.12 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  44.44 
 
 		 681 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  43.9 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  37.82 
 
 		 137 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  40.86 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  42 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  47.3 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  43.9 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  43.9 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  42.5 
 
 		 254 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  43.9 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  40.95 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>