104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2461 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  64.29 
 
 
215 aa  291  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  68.57 
 
 
218 aa  289  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  57.48 
 
 
225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  41.46 
 
 
222 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  35.1 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  40.78 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  37.38 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  37.02 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  33.17 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  35.18 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  33.67 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  35.18 
 
 
226 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  32.32 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  31.55 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  30.58 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  29.21 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  29.21 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  29.2 
 
 
199 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  28.47 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  28.23 
 
 
189 aa  58.2  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  29.03 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  29.03 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  32.48 
 
 
187 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  27.92 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  28.19 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  38.27 
 
 
258 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  37.63 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  29.91 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  25.9 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  31.25 
 
 
264 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  28.35 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  24.49 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  33.98 
 
 
393 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  27.84 
 
 
206 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  36.51 
 
 
345 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  33.75 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  31.15 
 
 
192 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  29.06 
 
 
345 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  29.92 
 
 
195 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  37.29 
 
 
344 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  25.98 
 
 
257 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  32.29 
 
 
251 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  31.65 
 
 
194 aa  45.1  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  35.96 
 
 
336 aa  45.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  37.29 
 
 
345 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  29.06 
 
 
345 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  29.06 
 
 
345 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  29.37 
 
 
193 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  37.29 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  28.97 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  28.97 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  37.29 
 
 
344 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  37.29 
 
 
345 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  37.29 
 
 
345 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  37.29 
 
 
344 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  27.59 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  27.84 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  27.59 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  32.5 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  27.59 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  32.97 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  27.59 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  35.82 
 
 
270 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  25.9 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  25.9 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  25.9 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  25.9 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  32.79 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.95 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1757  hypothetical protein  36.36 
 
 
266 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  0.0972712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  36.36 
 
 
266 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  36.36 
 
 
266 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1516  protein YdcF  36.36 
 
 
266 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1699  hypothetical protein  36.36 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  hitchhiker  0.00242518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  30.86 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  23.48 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  28.29 
 
 
199 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  27.38 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2071  hypothetical protein  44 
 
 
401 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  29.51 
 
 
190 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  29.63 
 
 
185 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  29.63 
 
 
185 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  29.63 
 
 
185 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  29.63 
 
 
185 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1006  hypothetical protein  24.06 
 
 
264 aa  42  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0861939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  25.18 
 
 
266 aa  42  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  30.86 
 
 
178 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  29.63 
 
 
185 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>