More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1441 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1441  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 232 aa  455  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0834  50S ribosomal protein L1  82.76 
 
 		 233 aa  367  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  74.14 
 
 		 232 aa  348  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  65.65 
 
 		 231 aa  304  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  64.81 
 
 		 232 aa  304  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  62.23 
 
 		 232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 231 aa  300  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  65.33 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  64.6 
 
 		 233 aa  298  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  63.48 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  63.48 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  63.48 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  65.78 
 
 		 229 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 229 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  64.35 
 
 		 232 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  67.59 
 
 		 231 aa  293  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  62.5 
 
 		 232 aa  292  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  63.2 
 
 		 230 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  64.32 
 
 		 233 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  63.88 
 
 		 233 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  63.64 
 
 		 232 aa  291  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  64.5 
 
 		 231 aa  290  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  64.41 
 
 		 229 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  61.57 
 
 		 232 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  61.14 
 
 		 232 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 232 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1944  50S ribosomal protein L1  65.07 
 
 		 233 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1528  50S ribosomal protein L1  64.94 
 
 		 230 aa  280  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  60.17 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3843  50S ribosomal protein L1  64.89 
 
 		 232 aa  278  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528602  normal  0.697118 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0568  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 		 232 aa  278  5e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000788355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1247  50S ribosomal protein L1  63.76 
 
 		 233 aa  278  6e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1208  50S ribosomal protein L1  63.76 
 
 		 233 aa  278  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1347  50S ribosomal protein L1  63.64 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  62.93 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 		 232 aa  275  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5086  50S ribosomal protein L1  65.78 
 
 		 230 aa  275  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00155922  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  60.34 
 
 		 235 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 231 aa  274  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 231 aa  274  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1955  50S ribosomal protein L1  64.35 
 
 		 230 aa  274  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 231 aa  274  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  59.48 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 233 aa  271  6e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3454  50S ribosomal protein L1P  61.21 
 
 		 235 aa  271  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298186  normal  0.29676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2698  50S ribosomal protein L1  65.09 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 233 aa  268  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 234 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 234 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4434  50S ribosomal protein L1  64.35 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  59.48 
 
 		 232 aa  265  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 234 aa  264  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 230 aa  264  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0309  50S ribosomal protein L1P  59.39 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440135  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0837  50S ribosomal protein L1P  60.26 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0423664  normal  0.0981496 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 232 aa  261  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 232 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4480  50S ribosomal protein L1  62.5 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0876536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3337  50S ribosomal protein L1  57.58 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3999  50S ribosomal protein L1  62.07 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.981145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  53.45 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4368  50S ribosomal protein L1  62.07 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 233 aa  258  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  54.31 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 233 aa  258  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0039  50S ribosomal protein L1  55.17 
 
 		 233 aa  258  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138059  hitchhiker  0.00000000000807787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3249  50S ribosomal protein L1  59.39 
 
 		 231 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3900  50S ribosomal protein L1  59.39 
 
 		 231 aa  258  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  53.48 
 
 		 233 aa  257  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 233 aa  257  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4534  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0148  ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000518131  normal  0.0355944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>