More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3249 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3249  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 231 aa  450  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3900  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 231 aa  450  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4534  50S ribosomal protein L1  96.1 
 
 		 231 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0507  50S ribosomal protein L1  92.64 
 
 		 231 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0585  50S ribosomal protein L1  93.07 
 
 		 232 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3595  50S ribosomal protein L1  89.61 
 
 		 231 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.412655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2261  ribosomal protein L1  89.08 
 
 		 231 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  82.68 
 
 		 237 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4445  50S ribosomal protein L1  87.01 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.369013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3454  50S ribosomal protein L1P  84.85 
 
 		 235 aa  371  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298186  normal  0.29676 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  77.92 
 
 		 232 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  78.35 
 
 		 232 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  78.35 
 
 		 232 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  79.22 
 
 		 232 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  77.92 
 
 		 232 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  78.35 
 
 		 232 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3643  50S ribosomal protein L1  86.15 
 
 		 231 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  77.92 
 
 		 232 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  79.22 
 
 		 231 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  77.92 
 
 		 231 aa  364  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  79.22 
 
 		 231 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  77.49 
 
 		 232 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  78.35 
 
 		 232 aa  362  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  77.06 
 
 		 232 aa  361  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  77.06 
 
 		 232 aa  361  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  77.06 
 
 		 232 aa  361  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  77.06 
 
 		 232 aa  361  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  77.06 
 
 		 232 aa  361  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  77.06 
 
 		 232 aa  361  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  77.06 
 
 		 232 aa  361  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  77.06 
 
 		 232 aa  361  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  77.92 
 
 		 232 aa  361  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3337  50S ribosomal protein L1  75.32 
 
 		 231 aa  335  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0039  50S ribosomal protein L1  75.32 
 
 		 233 aa  332  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138059  hitchhiker  0.00000000000807787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0043  50S ribosomal protein L1  74.89 
 
 		 233 aa  332  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3192  50S ribosomal protein L1  76.62 
 
 		 231 aa  331  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.406576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 233 aa  328  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  70.13 
 
 		 231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  69.43 
 
 		 282 aa  325  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  69.43 
 
 		 232 aa  320  9.000000000000001e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0309  50S ribosomal protein L1P  75.32 
 
 		 231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440135  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0756  50S ribosomal protein L1  72.93 
 
 		 230 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0269  50S ribosomal protein L1  73.91 
 
 		 230 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  hitchhiker  0.00154879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  72.93 
 
 		 232 aa  317  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  67.56 
 
 		 233 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 233 aa  311  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  66.81 
 
 		 233 aa  311  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  65.07 
 
 		 229 aa  310  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  65.5 
 
 		 234 aa  308  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3734  ribosomal protein L1  71 
 
 		 234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0148  ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 233 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000518131  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0709  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 232 aa  305  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0274  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655427  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0336  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 234 aa  304  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00681469  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3863  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 234 aa  304  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2807  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 234 aa  304  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532362  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4556  50S ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 234 aa  304  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103924  decreased coverage  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4482  50S ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 234 aa  304  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  decreased coverage  0.0000000000000063048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4360  50S ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 234 aa  304  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0197515  normal  0.388445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4479  50S ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 234 aa  304  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0614276  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4392  50S ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 234 aa  304  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  66.52 
 
 		 231 aa  304  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 231 aa  301  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3888  ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 234 aa  299  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2334  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 231 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.505693  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0316  50S ribosomal protein L1  68.89 
 
 		 230 aa  299  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0487  50S ribosomal protein L1  68.89 
 
 		 230 aa  299  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0570658  hitchhiker  0.00000155612 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  61.74 
 
 		 232 aa  298  3e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03860  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000865195  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5449  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000118396  hitchhiker  0.00123384 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4217  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.26604e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03813  hypothetical protein  68.4 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000121828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4041  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000597884  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4472  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362466  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4524  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4432  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000639921  hitchhiker  0.0000029085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0194  50S ribosomal protein L1  69.33 
 
 		 234 aa  298  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000443465  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1063  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 231 aa  298  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0602308  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  61.74 
 
 		 232 aa  298  5e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0285  ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 231 aa  297  9e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000742644  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4011  ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 234 aa  297  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4700  50S ribosomal protein L1  69.57 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000139189  hitchhiker  0.00000553638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0827  50S ribosomal protein L1  66.23 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0116287  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3769  50S ribosomal protein L1  69.43 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000012914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0189  50S ribosomal protein L1  69 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000305059  hitchhiker  0.00355335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0184  50S ribosomal protein L1  69 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000067503  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08730  50S ribosomal protein L1  66.23 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0189  50S ribosomal protein L1  69 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324353  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3449  ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 234 aa  295  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000354008  hitchhiker  0.00724733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0203  50S ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 233 aa  295  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000988854  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0202  50S ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 234 aa  295  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0394822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2727  50S ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 233 aa  294  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000405483  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0221  50S ribosomal protein L1  68.56 
 
 		 233 aa  293  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0616  ribosomal protein L1  65.37 
 
 		 231 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4759  50S ribosomal protein L1  64.94 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00425214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4558  50S ribosomal protein L1  64.94 
 
 		 231 aa  291  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759483  normal  0.0544864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0138  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 233 aa  292  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000376196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4327  50S ribosomal protein L1  69 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000769687  hitchhiker  0.00000000219942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0207  50S ribosomal protein L1  67.1 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000293924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0160  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000041056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>