More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0940 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 438 aa  889    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  71.71 
 
 		 444 aa  594  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  66.59 
 
 		 438 aa  578  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  64.5 
 
 		 428 aa  532  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  56.07 
 
 		 453 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  51.06 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  49.53 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  48.4 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  49.76 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  47.16 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  46.82 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  48.97 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  45.39 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  43.07 
 
 		 471 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  43.07 
 
 		 470 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  42.93 
 
 		 419 aa  322  7e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  43.37 
 
 		 447 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  44.8 
 
 		 420 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  44.17 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  46.15 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  42.21 
 
 		 421 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  42.12 
 
 		 439 aa  303  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  43.14 
 
 		 424 aa  302  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  41.87 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  41.77 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  42.89 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  42.45 
 
 		 422 aa  289  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  45.72 
 
 		 405 aa  289  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  43.03 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  44.81 
 
 		 422 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  44.81 
 
 		 422 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  44.56 
 
 		 422 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  44.78 
 
 		 420 aa  279  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  42.11 
 
 		 575 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  38.6 
 
 		 1270 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  42.29 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  42.89 
 
 		 427 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  42.46 
 
 		 367 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  43.21 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  42.01 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  39.9 
 
 		 653 aa  251  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  41.23 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  42.98 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.06 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  42.17 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  39.71 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  37.25 
 
 		 435 aa  235  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  36.57 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  38.73 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  44.97 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  38.14 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7452  peptidase M20D, amidohydrolase  40.11 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  40.4 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  39.66 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  36.6 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  43.84 
 
 		 399 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  37 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  38 
 
 		 396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  35.71 
 
 		 431 aa  226  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  39.27 
 
 		 412 aa  226  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  39.53 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  39.53 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  36.54 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  34.61 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  39.53 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  36.5 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  36.74 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  39 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  39 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  39.35 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  44.29 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  39 
 
 		 396 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  39 
 
 		 396 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  39 
 
 		 396 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  39 
 
 		 396 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  37.99 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  34.1 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  35.31 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  39.82 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  40.47 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  36.75 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  39 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  36.19 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  35.64 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  37.97 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  35.18 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  37.97 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  39.23 
 
 		 387 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  39.11 
 
 		 387 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  37.57 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  37.54 
 
 		 383 aa  221  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  40.05 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  37.08 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  38.76 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  40.94 
 
 		 393 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  39.71 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  37.54 
 
 		 383 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  37.36 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  39.05 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>