More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1165 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0939  DNA polymerase III DnaE  61.39 
 
 		 1034 aa  1325    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0519  DNA polymerase III DnaE  43.59 
 
 		 1070 aa  865    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  100 
 
 		 1036 aa  2125    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.83 
 
 		 1115 aa  632  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.68 
 
 		 1112 aa  623  1e-177  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  34.98 
 
 		 1108 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  34.95 
 
 		 1108 aa  621  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  34.82 
 
 		 1108 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  34.79 
 
 		 1108 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  34.79 
 
 		 1108 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  34.79 
 
 		 1108 aa  622  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  34.79 
 
 		 1108 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  34.79 
 
 		 1108 aa  619  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  34.79 
 
 		 1108 aa  619  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  34.55 
 
 		 1110 aa  609  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  33.79 
 
 		 1109 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  34.87 
 
 		 1104 aa  592  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  34.19 
 
 		 1092 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  36.01 
 
 		 1038 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.44 
 
 		 1134 aa  548  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  34.44 
 
 		 1065 aa  545  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 1065 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 1065 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1000  DNA polymerase III, alpha subunit  35.65 
 
 		 960 aa  531  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  31.79 
 
 		 1145 aa  529  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  31.72 
 
 		 1156 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  32.76 
 
 		 1171 aa  519  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  32.38 
 
 		 1127 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  32.09 
 
 		 1139 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  31.61 
 
 		 1145 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  32.7 
 
 		 1171 aa  505  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.91 
 
 		 1122 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  31.3 
 
 		 1164 aa  506  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  31.82 
 
 		 1149 aa  501  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  31.33 
 
 		 1075 aa  502  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  31.91 
 
 		 1143 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  33.61 
 
 		 1168 aa  498  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1148 aa  498  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  30.93 
 
 		 1170 aa  495  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  31.89 
 
 		 1165 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  33.27 
 
 		 1172 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  31.73 
 
 		 1148 aa  490  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  31.73 
 
 		 1143 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  31.16 
 
 		 1151 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  31.76 
 
 		 1165 aa  493  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  32.23 
 
 		 1132 aa  490  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  31.12 
 
 		 1195 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  30.26 
 
 		 1225 aa  489  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38840  DNA polymerase III subunit alpha  32 
 
 		 1176 aa  489  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  32.12 
 
 		 1185 aa  486  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  30.67 
 
 		 1139 aa  485  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.39 
 
 		 1170 aa  485  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  31.68 
 
 		 1165 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  31.24 
 
 		 1173 aa  486  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  32.04 
 
 		 1173 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  30.79 
 
 		 1167 aa  481  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  32.37 
 
 		 1172 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  31.73 
 
 		 1181 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  31.77 
 
 		 1165 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  32.05 
 
 		 1172 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  31.7 
 
 		 1159 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  31.77 
 
 		 1162 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  33.17 
 
 		 1167 aa  479  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  33.17 
 
 		 1166 aa  479  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  31.51 
 
 		 1174 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  31.96 
 
 		 1172 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  31.16 
 
 		 1148 aa  476  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  31.16 
 
 		 1148 aa  476  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  32.99 
 
 		 1174 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  29.84 
 
 		 1159 aa  475  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  33.09 
 
 		 1161 aa  475  1e-132  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.05 
 
 		 1165 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  30.81 
 
 		 1155 aa  475  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  31.64 
 
 		 1168 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  31.24 
 
 		 1170 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  31.17 
 
 		 1174 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  31.51 
 
 		 1165 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1161  DNA polymerase III subunit alpha  31.32 
 
 		 1174 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0775975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  30.98 
 
 		 1176 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  31.17 
 
 		 1174 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  31.2 
 
 		 1160 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  31.67 
 
 		 1173 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  30.08 
 
 		 1158 aa  469  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  31.2 
 
 		 1160 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  31.2 
 
 		 1160 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  31.84 
 
 		 1130 aa  469  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  31.2 
 
 		 1160 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  29.49 
 
 		 1184 aa  469  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  31.09 
 
 		 1173 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  31.02 
 
 		 1160 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  31.04 
 
 		 1173 aa  465  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  30.55 
 
 		 1179 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  30.73 
 
 		 1171 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  30.68 
 
 		 1165 aa  464  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  30.64 
 
 		 1160 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  30.59 
 
 		 1160 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  30.64 
 
 		 1160 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  30.64 
 
 		 1160 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  30.64 
 
 		 1160 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  30.68 
 
 		 1171 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>