More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1090 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  100 
 
 
226 aa  457  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  75.89 
 
 
227 aa  348  5e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  64.13 
 
 
220 aa  278  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  56.6 
 
 
224 aa  244  6.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  56.74 
 
 
224 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  55.14 
 
 
225 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  53.74 
 
 
225 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  53.74 
 
 
225 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  53.74 
 
 
225 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  53.74 
 
 
225 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  53.74 
 
 
225 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  53.74 
 
 
225 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  53.74 
 
 
225 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  53.74 
 
 
225 aa  227  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  53.74 
 
 
225 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  53.27 
 
 
225 aa  223  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  53.39 
 
 
230 aa  223  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  50.47 
 
 
219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  51.16 
 
 
219 aa  207  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  51.16 
 
 
219 aa  207  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  51.38 
 
 
215 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  53.7 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  45.33 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  49.52 
 
 
228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  48.1 
 
 
229 aa  194  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.09 
 
 
534 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  50 
 
 
222 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  46.19 
 
 
226 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  47.2 
 
 
232 aa  191  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.87 
 
 
528 aa  188  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.21 
 
 
511 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.21 
 
 
511 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  50.67 
 
 
228 aa  186  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  48.29 
 
 
539 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  45.91 
 
 
217 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  46.61 
 
 
238 aa  184  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  47.69 
 
 
236 aa  184  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  44.76 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  47.89 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  43.78 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  48.08 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  45.58 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  45 
 
 
217 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  48.84 
 
 
221 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  44.54 
 
 
237 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  45 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.93 
 
 
516 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.6 
 
 
529 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  45.75 
 
 
218 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.66 
 
 
527 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.45 
 
 
516 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  43.29 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  40.83 
 
 
234 aa  177  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  46.54 
 
 
224 aa  177  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  43.4 
 
 
219 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.85 
 
 
526 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  39.35 
 
 
225 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  46.33 
 
 
227 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  43.67 
 
 
231 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  45.62 
 
 
213 aa  175  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.54 
 
 
673 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  44.13 
 
 
229 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.54 
 
 
673 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.08 
 
 
480 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.66 
 
 
510 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  44.09 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  41.1 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  43.33 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.15 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  43.19 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  41.63 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.97 
 
 
488 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.71 
 
 
231 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  40.99 
 
 
233 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.13 
 
 
229 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  43.5 
 
 
228 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  42.59 
 
 
223 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  38.64 
 
 
230 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  38.64 
 
 
230 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  44.08 
 
 
229 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  41.59 
 
 
227 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  43.87 
 
 
214 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  44.39 
 
 
228 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  39.19 
 
 
230 aa  168  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  42.21 
 
 
225 aa  167  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  42.38 
 
 
223 aa  167  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  45.95 
 
 
217 aa  167  9e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  41.59 
 
 
222 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  43.4 
 
 
232 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  39.81 
 
 
232 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  43.81 
 
 
216 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  42.38 
 
 
226 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  42.38 
 
 
226 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  41.78 
 
 
228 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  41.78 
 
 
228 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  41.78 
 
 
228 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  41.1 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  40.71 
 
 
269 aa  165  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  38.74 
 
 
233 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  40.76 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>