More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0114 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1360  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  57.49 
 
 		 698 aa  795    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10960  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  48.53 
 
 		 743 aa  636    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000522629  unclonable  0.00000000397306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3818  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  60.23 
 
 		 712 aa  832    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.79465e-59 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.07 
 
 		 701 aa  805    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0949  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.12 
 
 		 747 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3845  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  60.52 
 
 		 712 aa  835    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.35 
 
 		 696 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0203  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  81.68 
 
 		 709 aa  1165    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1950  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.15 
 
 		 740 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.139447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3658  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  60.37 
 
 		 712 aa  833    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3548  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  60.23 
 
 		 712 aa  831    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3566  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  60.23 
 
 		 712 aa  831    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1639  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.7 
 
 		 700 aa  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2816  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.78 
 
 		 729 aa  648    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2685  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.78 
 
 		 729 aa  645    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0635  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.44 
 
 		 716 aa  647    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1979  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  47.98 
 
 		 710 aa  648    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000019638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3854  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  60.52 
 
 		 712 aa  835    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2763  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.43 
 
 		 698 aa  661    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  52.88 
 
 		 705 aa  720    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3670  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.83 
 
 		 723 aa  699    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 703 aa  675    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  58.89 
 
 		 723 aa  814    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.78 
 
 		 697 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1450  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  51.48 
 
 		 718 aa  702    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.103052  normal  0.272177 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  60.37 
 
 		 712 aa  833    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4382  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.11 
 
 		 712 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.42 
 
 		 747 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000737281  hitchhiker  0.00038852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  59.72 
 
 		 712 aa  848    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  60.23 
 
 		 712 aa  833    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0729219 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.15 
 
 		 701 aa  686    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  60.34 
 
 		 710 aa  841    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1334  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  57.49 
 
 		 698 aa  795    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2075  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.92 
 
 		 712 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.57561 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.94 
 
 		 700 aa  685    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0615  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  50.36 
 
 		 711 aa  640    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3180  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  47.79 
 
 		 746 aa  667    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.846647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1442  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  53.91 
 
 		 735 aa  743    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3629  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  59.94 
 
 		 717 aa  823    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1656  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.94 
 
 		 736 aa  640    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.64 
 
 		 703 aa  674    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.80141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3905  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  60.09 
 
 		 712 aa  829    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2047  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  78.92 
 
 		 769 aa  1128    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0512862  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0114  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  100 
 
 		 741 aa  1506    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.613671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.28 
 
 		 701 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.21 
 
 		 697 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.38 
 
 		 696 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.81 
 
 		 696 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.66 
 
 		 755 aa  632  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.13 
 
 		 777 aa  635  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.41 
 
 		 686 aa  632  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00293848  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2997  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.95 
 
 		 711 aa  630  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1561  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.63 
 
 		 699 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000108143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3588  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.56 
 
 		 746 aa  631  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0398  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  47.04 
 
 		 732 aa  630  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.28 
 
 		 722 aa  631  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  47.25 
 
 		 714 aa  626  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.9 
 
 		 728 aa  626  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0176906  hitchhiker  0.00320297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2017  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.99 
 
 		 718 aa  627  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000536157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3192  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  47.52 
 
 		 715 aa  628  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.002791  normal  0.0369352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2081  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.34 
 
 		 714 aa  628  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0369235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1934  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.93 
 
 		 702 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.93 
 
 		 702 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0861  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.64 
 
 		 720 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3050  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.75 
 
 		 710 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.464324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0175  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.33 
 
 		 714 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.41 
 
 		 706 aa  626  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4396  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.45 
 
 		 745 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.735081 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.09 
 
 		 721 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.2 
 
 		 714 aa  623  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.95 
 
 		 721 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01307  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.98 
 
 		 704 aa  623  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3232  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.97 
 
 		 761 aa  622  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.555601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.95 
 
 		 749 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0939  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.41 
 
 		 739 aa  623  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57478  normal  0.652932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4027  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.45 
 
 		 752 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.749576  normal  0.189287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4507  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.16 
 
 		 745 aa  623  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.398327 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_843  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  45.32 
 
 		 720 aa  624  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.946894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3342  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.97 
 
 		 722 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.55 
 
 		 720 aa  621  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0071  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.91 
 
 		 714 aa  619  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000128899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0589  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.12 
 
 		 706 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.77 
 
 		 706 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0703  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.4 
 
 		 713 aa  619  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0934  3' exoribonuclease  47.22 
 
 		 741 aa  620  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00161965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.12 
 
 		 734 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  49.12 
 
 		 711 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3446  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.83 
 
 		 714 aa  618  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2897  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.62 
 
 		 725 aa  618  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4916  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.82 
 
 		 725 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  47.34 
 
 		 733 aa  617  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.12 
 
 		 711 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2420  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.71 
 
 		 736 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.62 
 
 		 707 aa  617  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0401  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.85 
 
 		 721 aa  615  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.41 
 
 		 712 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.2 
 
 		 696 aa  616  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0788  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  45.82 
 
 		 732 aa  615  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000677019  normal  0.144869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.12 
 
 		 720 aa  615  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3556  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.75 
 
 		 702 aa  618  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>