86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0480 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  84.93 
 
 		 146 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  83.56 
 
 		 146 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  83.56 
 
 		 147 aa  258  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  84.93 
 
 		 147 aa  255  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  84.25 
 
 		 147 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  83.56 
 
 		 147 aa  254  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  66.2 
 
 		 142 aa  218  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  65.49 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  63.01 
 
 		 151 aa  197  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  70.49 
 
 		 142 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  59.03 
 
 		 152 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  70.49 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  64.75 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 689 aa  99.4  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  33.57 
 
 		 688 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  32.56 
 
 		 670 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  36.49 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.51 
 
 		 389 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  38.03 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2303  rhodanese-like protein  38.36 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.788958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  31.91 
 
 		 1240 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  28.99 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  31.88 
 
 		 377 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  28.19 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 		 173 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  23.58 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  28.43 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.98 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  38.18 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 		 454 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  29 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  30.91 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  31.03 
 
 		 146 aa  43.5  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  30.07 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  43.5  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  27.43 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  28.7 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.41 
 
 		 388 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  27.47 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  26.81 
 
 		 353 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  25.42 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  26.44 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  30.68 
 
 		 103 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 130 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.49 
 
 		 247 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  28.72 
 
 		 254 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  28.44 
 
 		 173 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  24.39 
 
 		 145 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  31 
 
 		 152 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 179 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 228 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 406 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  25.51 
 
 		 141 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  43.14 
 
 		 173 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  25.51 
 
 		 141 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.89 
 
 		 480 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  28.76 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  24.53 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  26.97 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  26.14 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  29.49 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  26.45 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 226 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  26.97 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  30.77 
 
 		 423 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  23.14 
 
 		 177 aa  40  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  26.13 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  28.97 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>