More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0232 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  100 
 
 		 496 aa  989    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  84.99 
 
 		 494 aa  828    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  84.99 
 
 		 494 aa  828    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  44.72 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  39.26 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  36.46 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  34.23 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  34.78 
 
 		 436 aa  243  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  30.74 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  30.82 
 
 		 480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  30.8 
 
 		 480 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  30.59 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  31.73 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  32.58 
 
 		 451 aa  203  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  28.02 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  23.67 
 
 		 494 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 490 aa  108  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 482 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 482 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 549 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  23.08 
 
 		 465 aa  97.4  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 466 aa  97.1  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  26.22 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 566 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 501 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 518 aa  94  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 454 aa  93.6  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 463 aa  93.6  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 		 486 aa  93.2  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 500 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 449 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 510 aa  91.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.77 
 
 		 486 aa  90.5  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.77 
 
 		 486 aa  90.5  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  23.52 
 
 		 480 aa  90.5  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  24.35 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  27.05 
 
 		 476 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  21.76 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 770 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  21.44 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  25.15 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25.81 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  21.95 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  22.83 
 
 		 506 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  24.79 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  24.67 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  24.01 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  23.08 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.51 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  22.68 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  20.99 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  22.75 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  25.75 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  26.11 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  27.18 
 
 		 753 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  22.74 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  22.88 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  24.68 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  23.92 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.57 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  24.88 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  22.29 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  21.54 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  21.54 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  23.04 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  26.09 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  25.38 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  24.24 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  23.52 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  21.32 
 
 		 471 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>