285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2957 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  72 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  46.98 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  44.5 
 
 		 575 aa  194  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  41.36 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  42.4 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.51 
 
 		 488 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  41.94 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  43.57 
 
 		 367 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.83 
 
 		 367 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  44.73 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  43.96 
 
 		 367 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  40.76 
 
 		 215 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.28 
 
 		 215 aa  165  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  35.68 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  35.68 
 
 		 218 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  38.39 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  41.95 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  38.39 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  38.57 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  35.21 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  38.57 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  35.21 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  37.5 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  35.71 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  37.56 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  35.71 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  35.71 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  35.71 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  35.71 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  35.71 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.33 
 
 		 562 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  41.15 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  42.86 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  38.5 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  34.58 
 
 		 442 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  39.23 
 
 		 422 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0198  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  36.22 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  33.48 
 
 		 449 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  32.18 
 
 		 472 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  37.3 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.23 
 
 		 431 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  34.04 
 
 		 428 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.32 
 
 		 426 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  35.94 
 
 		 422 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  32.53 
 
 		 451 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.87 
 
 		 424 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.8 
 
 		 466 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.24 
 
 		 425 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.16 
 
 		 418 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  35.78 
 
 		 409 aa  135  9e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  41.85 
 
 		 429 aa  135  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  36.45 
 
 		 426 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  36.45 
 
 		 466 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.63 
 
 		 410 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.77 
 
 		 445 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  36 
 
 		 394 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.05 
 
 		 440 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  36.71 
 
 		 689 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6797  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.8 
 
 		 420 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0708619  normal  0.644393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  33.05 
 
 		 445 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  35.02 
 
 		 690 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  36.71 
 
 		 688 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  38.57 
 
 		 421 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.94 
 
 		 439 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.05 
 
 		 445 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1491  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.36 
 
 		 432 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0511  cytochrome b/b6  36.49 
 
 		 408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000312335  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1542  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.36 
 
 		 432 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.836015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  36.84 
 
 		 426 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  35.02 
 
 		 422 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1624  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.36 
 
 		 431 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  34.86 
 
 		 688 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0521  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.49 
 
 		 408 aa  132  7.999999999999999e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.518371  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  34.17 
 
 		 403 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  35.32 
 
 		 687 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7536  Cytochrome b/b6 domain protein  37.5 
 
 		 428 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0448545  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  39.13 
 
 		 429 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  34.6 
 
 		 464 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  35.75 
 
 		 689 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.78 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  34.4 
 
 		 688 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  37.76 
 
 		 473 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  32.74 
 
 		 464 aa  128  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  32.02 
 
 		 583 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.24 
 
 		 472 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  33.19 
 
 		 488 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  38.39 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  37.44 
 
 		 459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>