More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2456 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 541 aa  1074    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  54.88 
 
 		 521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.2 
 
 		 521 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.88 
 
 		 550 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.08 
 
 		 540 aa  522  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  54.67 
 
 		 518 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.45 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  52.78 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.98 
 
 		 534 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  50.4 
 
 		 531 aa  485  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.76 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.09 
 
 		 538 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.78 
 
 		 537 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  53.86 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.64 
 
 		 518 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  49.38 
 
 		 517 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.34 
 
 		 526 aa  438  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.6 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.68 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  53.48 
 
 		 534 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.93 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.39 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  50.77 
 
 		 547 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.8 
 
 		 510 aa  355  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.54 
 
 		 522 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 505 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 505 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 505 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  39.51 
 
 		 512 aa  310  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  39.1 
 
 		 509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  39.49 
 
 		 493 aa  303  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 		 494 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.86 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.51 
 
 		 486 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  36.46 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.62 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.68 
 
 		 496 aa  289  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  37.79 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  38.15 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  36.67 
 
 		 488 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  37.04 
 
 		 488 aa  286  9e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.25 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.869988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36 
 
 		 494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  38.79 
 
 		 480 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.43 
 
 		 494 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  34.78 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  40.98 
 
 		 529 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  37.79 
 
 		 482 aa  280  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  36.32 
 
 		 502 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  35.84 
 
 		 494 aa  279  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.34 
 
 		 483 aa  279  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 517 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  39.57 
 
 		 491 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.73 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  37.05 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 		 498 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.87 
 
 		 461 aa  277  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  35.37 
 
 		 491 aa  277  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.39 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 494 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  38.09 
 
 		 504 aa  276  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 494 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 494 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1344  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.11 
 
 		 488 aa  276  9e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.48 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.96 
 
 		 494 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  36.88 
 
 		 491 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.17 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.55 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.55 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.55 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  36.25 
 
 		 494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.55 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  35.96 
 
 		 490 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.33 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 		 501 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.3 
 
 		 494 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 		 488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.05 
 
 		 484 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.9 
 
 		 495 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 		 494 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.27 
 
 		 479 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.33 
 
 		 483 aa  273  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.33 
 
 		 483 aa  273  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.55 
 
 		 483 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 492 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.2 
 
 		 487 aa  273  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4430  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  38.59 
 
 		 496 aa  273  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81725  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 		 500 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 475 aa  273  7e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 		 500 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0145  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.31 
 
 		 480 aa  273  8.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 		 495 aa  272  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.33 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  35.9 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 481 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>