More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1017 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1017  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
449 aa  840    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.943226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0861  metal dependent phosphohydrolase  35.35 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.502442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 
506 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  23.29 
 
 
424 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  37.67 
 
 
547 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  37.67 
 
 
547 aa  100  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  45.65 
 
 
868 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
692 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.79 
 
 
491 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
444 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 
428 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
331 aa  96.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 
545 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 
611 aa  96.3  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 
428 aa  96.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
618 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 
196 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 
615 aa  94.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  42.47 
 
 
550 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 
462 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 
505 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  37.58 
 
 
632 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  34.94 
 
 
718 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 
326 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  38.82 
 
 
553 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 
428 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 
534 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 
718 aa  91.3  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
710 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 
719 aa  90.1  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4403  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
319 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 
571 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  36.48 
 
 
836 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1513  metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
469 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  36.81 
 
 
481 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 
452 aa  87.4  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
498 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 
363 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 
451 aa  86.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 
703 aa  87  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 
451 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  36.2 
 
 
848 aa  86.7  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 
703 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.71 
 
 
841 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 
648 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2085  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.09 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.012958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.86 
 
 
719 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  24.35 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  33.33 
 
 
712 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 
467 aa  84.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.47 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
518 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
298 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.87 
 
 
971 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  38.92 
 
 
1171 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2799  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 
462 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
1073 aa  84  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5850  metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 
457 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  31.63 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
643 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  36.71 
 
 
792 aa  83.2  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  27.31 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
643 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
643 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
643 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 
736 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
643 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  34.9 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.97 
 
 
860 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  32.14 
 
 
334 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.97 
 
 
880 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
642 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
652 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0732  metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 
172 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  28.02 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  28.02 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  28.02 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  28.02 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.41 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
647 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  28.02 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  39.04 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 
631 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  33.11 
 
 
495 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.43 
 
 
853 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3290  metal dependent phosphohydrolase  31.74 
 
 
202 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  30.77 
 
 
876 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 
496 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>