266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3821 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  82.13 
 
 		 550 aa  651    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  81.89 
 
 		 550 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3821  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  813    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  48.03 
 
 		 555 aa  348  9e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  39.27 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  30.41 
 
 		 619 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  31.72 
 
 		 583 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.82 
 
 		 553 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.5 
 
 		 553 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.79 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.98 
 
 		 550 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.75 
 
 		 527 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.02 
 
 		 556 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.33 
 
 		 552 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.59 
 
 		 557 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  26.3 
 
 		 574 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.45 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.81 
 
 		 556 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.78 
 
 		 544 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.76 
 
 		 537 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 549 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.25 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.23 
 
 		 569 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.38 
 
 		 546 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  37.02 
 
 		 548 aa  140  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  37.19 
 
 		 536 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.43 
 
 		 560 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  28.54 
 
 		 616 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  31.23 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  32.62 
 
 		 548 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  32.62 
 
 		 548 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  32.62 
 
 		 548 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.13 
 
 		 543 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  32.01 
 
 		 544 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  31.49 
 
 		 547 aa  133  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  31.08 
 
 		 545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  27.96 
 
 		 596 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.76 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 552 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.6 
 
 		 542 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.98 
 
 		 540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.93 
 
 		 556 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  28.17 
 
 		 576 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  32.93 
 
 		 556 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  31.98 
 
 		 547 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  30.59 
 
 		 565 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  36.03 
 
 		 574 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  37.26 
 
 		 543 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  37.89 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  32.13 
 
 		 568 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  28.16 
 
 		 568 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  35.28 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.37 
 
 		 522 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.32 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.85 
 
 		 579 aa  120  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  27.25 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4441  Amidohydrolase 3  31.05 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  24.63 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.46 
 
 		 542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.31 
 
 		 542 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.96 
 
 		 530 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.12 
 
 		 522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  26.4 
 
 		 568 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  24.63 
 
 		 522 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  27.51 
 
 		 620 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  27.29 
 
 		 613 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  24.88 
 
 		 522 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  24.88 
 
 		 522 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  24.63 
 
 		 522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  40.7 
 
 		 532 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  24.63 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  32.27 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 560 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  31.19 
 
 		 544 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  27.53 
 
 		 608 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  25.71 
 
 		 606 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  27.74 
 
 		 560 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.74 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.88 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  30.36 
 
 		 541 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  29.81 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.2 
 
 		 564 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.53 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  34.48 
 
 		 525 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.88 
 
 		 520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 589 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  29.67 
 
 		 583 aa  110  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  27.49 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  21.95 
 
 		 526 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.07 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  30.52 
 
 		 580 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.51 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  29.33 
 
 		 583 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3848  Amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 564 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 541 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 548 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  25.76 
 
 		 580 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.94 
 
 		 537 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  28.27 
 
 		 551 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>