239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2737 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
476 aa  915    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  68.19 
 
 
481 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  67.57 
 
 
481 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  44.06 
 
 
486 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  42.19 
 
 
485 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  40.21 
 
 
487 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  36.21 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  29.7 
 
 
493 aa  167  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  31.3 
 
 
486 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  27.2 
 
 
484 aa  146  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  30.51 
 
 
489 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  28.99 
 
 
452 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 
483 aa  126  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  31.12 
 
 
487 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 
495 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  28.54 
 
 
484 aa  123  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  26.04 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 
490 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 
457 aa  121  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  30.72 
 
 
487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  28.72 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 
484 aa  118  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 
496 aa  117  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  29.04 
 
 
727 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  25.43 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  30.84 
 
 
613 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 
485 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 
623 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  25.72 
 
 
456 aa  106  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  25.78 
 
 
457 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  28.53 
 
 
626 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  28.22 
 
 
622 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  27.78 
 
 
623 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  27.54 
 
 
623 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  26.9 
 
 
566 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  28.51 
 
 
619 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.8 
 
 
464 aa  95.9  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  25.74 
 
 
457 aa  94.7  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  26.98 
 
 
472 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  23.67 
 
 
480 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  27.39 
 
 
588 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  26.79 
 
 
588 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 
503 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  25.3 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  28.71 
 
 
587 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  22 
 
 
489 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  30.12 
 
 
713 aa  84  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  26.88 
 
 
618 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  23.73 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  24.34 
 
 
611 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  26.89 
 
 
599 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  25.33 
 
 
583 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  30.03 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  26.97 
 
 
482 aa  80.1  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  23.27 
 
 
477 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  23.64 
 
 
454 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  25.93 
 
 
613 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  27.12 
 
 
631 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  23.89 
 
 
457 aa  77  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  22.94 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  27.94 
 
 
695 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  27.2 
 
 
637 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  25.99 
 
 
627 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  22.77 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  23.46 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  26.61 
 
 
631 aa  73.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  26.6 
 
 
657 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  24.69 
 
 
704 aa  73.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  27.16 
 
 
632 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  25.95 
 
 
632 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  27.16 
 
 
632 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  25.95 
 
 
642 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 
640 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  22.38 
 
 
478 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  26.05 
 
 
645 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  23.55 
 
 
696 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  26.05 
 
 
645 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  25.21 
 
 
525 aa  70.5  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
688 aa  70.1  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  28.25 
 
 
653 aa  70.1  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 
657 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  25.48 
 
 
585 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  24.39 
 
 
858 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  25.63 
 
 
697 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  24.39 
 
 
858 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  22.95 
 
 
548 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  25.52 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 
652 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  24.8 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 
657 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  23.53 
 
 
818 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  24.12 
 
 
464 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>