125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1509 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1509  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 294 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0113854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  80.55 
 
 		 295 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6216  carbohydrate kinase PfkB family  68.63 
 
 		 304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  55.1 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2307  PfkB  51.54 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.013346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1338  PfkB  47.62 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1547  putative carbohydrate kinase  50.56 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.23954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  35.64 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  34.01 
 
 		 363 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  26.19 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  30.83 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  35.86 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  30.64 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  36.27 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  36.65 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  25.65 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  24.32 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  30.68 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  25.28 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  26.99 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  26.99 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  31.73 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  22.87 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  25 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.16 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  40 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  28.19 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  28.67 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  28.67 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  28.67 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  28.67 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  34.58 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  28.67 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  34.58 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  27.41 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  34.58 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  34.58 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  34.58 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  34.58 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  34.58 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  28.33 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02430  conserved hypothetical protein  33.03 
 
 		 759 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  28.33 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  31.16 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.91 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.91 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.49 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.58 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.58 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.58 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  50.98 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.24 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  53.06 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  24.91 
 
 		 382 aa  50.1  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  42.11 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  45.28 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  45.28 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.67 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  24.69 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.3 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  24.76 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  32.27 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0298  fructokinase, putative  35.29 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  28.52 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.92 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  35.29 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  35.29 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  40.35 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  35.29 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  35.29 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  35.29 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  35.29 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  35.29 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  28.37 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.1 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  43.4 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  28.79 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  23.79 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  26.47 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.99 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  45.57 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  28.88 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  44 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  41.51 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  41.51 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  41.51 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  25.09 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  41.51 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  35.47 
 
 		 344 aa  45.8  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  29.29 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  27.48 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  39.76 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  39.01 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  35.06 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>