More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2011 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  64.93 
 
 		 540 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  100 
 
 		 560 aa  1099    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  68.32 
 
 		 545 aa  682    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  66.41 
 
 		 546 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  63.2 
 
 		 545 aa  668    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  66.73 
 
 		 540 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  63.95 
 
 		 534 aa  629  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  62.52 
 
 		 534 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  58.54 
 
 		 557 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  57.69 
 
 		 558 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  59.43 
 
 		 538 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  60.83 
 
 		 534 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  60.08 
 
 		 585 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  57.71 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  58.98 
 
 		 550 aa  588  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  61.73 
 
 		 538 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  58.78 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  59.89 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  57.52 
 
 		 544 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  57.41 
 
 		 554 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  57.86 
 
 		 552 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  54.7 
 
 		 549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  55.87 
 
 		 552 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.45 
 
 		 548 aa  554  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  57.28 
 
 		 553 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  56.9 
 
 		 550 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  55 
 
 		 552 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  59.92 
 
 		 549 aa  548  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  55.43 
 
 		 552 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  56.79 
 
 		 557 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  54.7 
 
 		 552 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  56.39 
 
 		 552 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  55.2 
 
 		 541 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  54.81 
 
 		 556 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  52.55 
 
 		 542 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  52.53 
 
 		 546 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  51.69 
 
 		 532 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  49.17 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.45 
 
 		 611 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  50.45 
 
 		 613 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  49.46 
 
 		 612 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  50.57 
 
 		 611 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.72 
 
 		 633 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  49.26 
 
 		 549 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  50.19 
 
 		 611 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  48.55 
 
 		 633 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  48.84 
 
 		 543 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  50.69 
 
 		 613 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  46.23 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  48.11 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  47.66 
 
 		 610 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.85 
 
 		 626 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 601 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  50.54 
 
 		 619 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  46.78 
 
 		 623 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  47.33 
 
 		 623 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.77 
 
 		 649 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.41 
 
 		 634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  49.34 
 
 		 615 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  48.11 
 
 		 609 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.41 
 
 		 634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  46.17 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.42 
 
 		 633 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.41 
 
 		 634 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  49.44 
 
 		 611 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  51.78 
 
 		 613 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  48.47 
 
 		 627 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  50.95 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  49.12 
 
 		 640 aa  465  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  50.94 
 
 		 592 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  51.13 
 
 		 592 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  49.62 
 
 		 534 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  49.12 
 
 		 640 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  47.4 
 
 		 606 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 623 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.76 
 
 		 612 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  47.54 
 
 		 624 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  49.06 
 
 		 536 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  45.08 
 
 		 583 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  47.76 
 
 		 624 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  48.77 
 
 		 546 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  50.75 
 
 		 592 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  49.03 
 
 		 624 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  47.76 
 
 		 612 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  50.76 
 
 		 539 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  48.24 
 
 		 542 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  47.94 
 
 		 629 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  50.48 
 
 		 531 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  47.83 
 
 		 530 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  49.53 
 
 		 536 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.47 
 
 		 534 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  48.53 
 
 		 593 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.58 
 
 		 632 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  50.66 
 
 		 539 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  47.76 
 
 		 623 aa  458  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  49.71 
 
 		 527 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.97 
 
 		 564 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>