More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4155 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  55.84 
 
 		 943 aa  993    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  57.01 
 
 		 955 aa  1057    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  100 
 
 		 950 aa  1916    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  61.51 
 
 		 941 aa  1115    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  73.13 
 
 		 948 aa  1421    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  45.67 
 
 		 920 aa  758    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  72.08 
 
 		 965 aa  1389    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  62.77 
 
 		 948 aa  1155    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  61.28 
 
 		 940 aa  1124    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  82.95 
 
 		 950 aa  1618    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  78.32 
 
 		 950 aa  1521    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  82.53 
 
 		 950 aa  1616    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  71.89 
 
 		 950 aa  1409    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.75 
 
 		 958 aa  834    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  65.58 
 
 		 942 aa  1163    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  61.82 
 
 		 941 aa  1121    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  65.26 
 
 		 940 aa  1164    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  42.38 
 
 		 632 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  50.67 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  49.6 
 
 		 380 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  49.6 
 
 		 383 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  51.06 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.82 
 
 		 552 aa  361  3e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  48.51 
 
 		 381 aa  357  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  50.68 
 
 		 365 aa  354  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  48.66 
 
 		 376 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  47.85 
 
 		 388 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  46.24 
 
 		 381 aa  340  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  48.26 
 
 		 373 aa  339  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  49.18 
 
 		 371 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  51.35 
 
 		 381 aa  320  7.999999999999999e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  47.67 
 
 		 366 aa  314  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  47.97 
 
 		 648 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  47.91 
 
 		 367 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  45.73 
 
 		 368 aa  311  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  47.49 
 
 		 367 aa  309  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  46.32 
 
 		 359 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  46.94 
 
 		 365 aa  306  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.87 
 
 		 572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  46.07 
 
 		 368 aa  305  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  47.81 
 
 		 377 aa  303  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  46.7 
 
 		 372 aa  303  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  46.45 
 
 		 369 aa  303  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  46.74 
 
 		 368 aa  301  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  46.13 
 
 		 392 aa  300  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  45.18 
 
 		 366 aa  300  9e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  45.58 
 
 		 392 aa  299  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  43.51 
 
 		 376 aa  297  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  46.83 
 
 		 367 aa  296  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  45.58 
 
 		 373 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  45.65 
 
 		 371 aa  295  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  44.96 
 
 		 387 aa  293  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  45.65 
 
 		 1053 aa  289  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  44.2 
 
 		 378 aa  288  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  43.87 
 
 		 371 aa  288  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  45.36 
 
 		 363 aa  287  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  45.36 
 
 		 363 aa  287  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  44.81 
 
 		 367 aa  287  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  43.2 
 
 		 373 aa  286  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  37.67 
 
 		 548 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  44.41 
 
 		 376 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  43.87 
 
 		 372 aa  284  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  36.48 
 
 		 577 aa  284  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  43.32 
 
 		 370 aa  283  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  39.08 
 
 		 534 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  33.87 
 
 		 568 aa  281  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  41.53 
 
 		 446 aa  281  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  44.74 
 
 		 370 aa  281  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.97 
 
 		 539 aa  280  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  39.67 
 
 		 555 aa  280  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  44.84 
 
 		 372 aa  278  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  36.67 
 
 		 545 aa  279  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  43.62 
 
 		 371 aa  278  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  42.93 
 
 		 373 aa  278  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  43.8 
 
 		 369 aa  277  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  39.38 
 
 		 542 aa  277  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  42.32 
 
 		 368 aa  277  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  34.9 
 
 		 544 aa  276  9e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  43.51 
 
 		 368 aa  276  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.98 
 
 		 543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  42.08 
 
 		 373 aa  274  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  43.53 
 
 		 372 aa  274  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  43.53 
 
 		 372 aa  274  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  42.66 
 
 		 371 aa  274  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  43.53 
 
 		 372 aa  274  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  36.87 
 
 		 547 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  39.16 
 
 		 555 aa  273  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  37.09 
 
 		 533 aa  271  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  37.88 
 
 		 538 aa  271  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  39.12 
 
 		 559 aa  270  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  43.05 
 
 		 368 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  40.65 
 
 		 374 aa  266  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  42.18 
 
 		 372 aa  265  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  41.03 
 
 		 384 aa  263  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  41.82 
 
 		 361 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13190  glucose-6-phosphate isomerase  36.89 
 
 		 580 aa  261  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.248571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  41.29 
 
 		 371 aa  260  7e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  39.95 
 
 		 360 aa  260  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  41.51 
 
 		 382 aa  260  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.73 
 
 		 532 aa  258  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>