210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4495 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  100 
 
 
368 aa  735    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  60.73 
 
 
382 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  60.34 
 
 
361 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  56.94 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  50.85 
 
 
357 aa  332  5e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  42.25 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.86 
 
 
958 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.41 
 
 
950 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  44.66 
 
 
377 aa  292  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  44.94 
 
 
367 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.24 
 
 
965 aa  287  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  44.32 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.32 
 
 
950 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  45.28 
 
 
373 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  43.78 
 
 
371 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  39.04 
 
 
381 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  40.88 
 
 
365 aa  279  6e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  44.26 
 
 
369 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.47 
 
 
948 aa  279  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  39.04 
 
 
381 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.32 
 
 
950 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  45 
 
 
359 aa  276  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.59 
 
 
950 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  38.8 
 
 
383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  44.05 
 
 
371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  42.7 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.82 
 
 
950 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  43.27 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  42.82 
 
 
648 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.86 
 
 
948 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  46.87 
 
 
381 aa  272  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  44.32 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  44.38 
 
 
377 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  37.27 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  43.58 
 
 
920 aa  269  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  40.72 
 
 
373 aa  268  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  43.09 
 
 
383 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  41.62 
 
 
378 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  42.69 
 
 
392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.7 
 
 
940 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  42.69 
 
 
370 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  44.08 
 
 
371 aa  264  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  40.97 
 
 
372 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  40.5 
 
 
366 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  42.46 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  41.9 
 
 
368 aa  262  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  40.96 
 
 
392 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  40.38 
 
 
955 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  41.48 
 
 
371 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  42.69 
 
 
373 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  42.42 
 
 
368 aa  260  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  41.97 
 
 
363 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  41.97 
 
 
363 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  39.08 
 
 
388 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  41.91 
 
 
366 aa  258  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  42.33 
 
 
367 aa  258  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  43.18 
 
 
376 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  40.4 
 
 
373 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.93 
 
 
941 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.93 
 
 
941 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  41.83 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.64 
 
 
940 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  40.61 
 
 
369 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  40.8 
 
 
373 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.29 
 
 
942 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  40.23 
 
 
372 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  40.74 
 
 
365 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  40.52 
 
 
372 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  40.52 
 
 
372 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  40.52 
 
 
372 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  39.15 
 
 
367 aa  247  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  41.81 
 
 
384 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  39.06 
 
 
368 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  39.38 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  38.59 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  43.9 
 
 
383 aa  242  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  40.5 
 
 
446 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  39.17 
 
 
374 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  37.15 
 
 
387 aa  237  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  40.8 
 
 
943 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  40.11 
 
 
1053 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  35.36 
 
 
376 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  36.09 
 
 
374 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  34.88 
 
 
374 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  32.08 
 
 
326 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  32.67 
 
 
371 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  33.24 
 
 
346 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  28.21 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  30.86 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  27.49 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  27.19 
 
 
325 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  28.61 
 
 
334 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  26.9 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  28.08 
 
 
331 aa  119  9e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  27.33 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  25.59 
 
 
323 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6478  transaldolase  28.41 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1925  transaldolase  26.69 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1175  transaldolase  33.15 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04593  transaldolase B  26.25 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>