239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2057 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  100 
 
 		 367 aa  739    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  63.76 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  65.47 
 
 		 368 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  62.02 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  63.59 
 
 		 373 aa  441  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  61.93 
 
 		 372 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  61.93 
 
 		 372 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  61.93 
 
 		 372 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  61.13 
 
 		 371 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  60.75 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  61.64 
 
 		 392 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  62.57 
 
 		 378 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  61.81 
 
 		 392 aa  434  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  61.75 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  61.93 
 
 		 372 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  61.05 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  61.37 
 
 		 372 aa  428  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  62.06 
 
 		 372 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  60.6 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  62.09 
 
 		 371 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  60.16 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  60 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  59.84 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  61.88 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  58.56 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  59.44 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  58.89 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  58.11 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  56.99 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  56.25 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  56.68 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  59.44 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  58.01 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  57.38 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  54.78 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  55.76 
 
 		 383 aa  362  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  54.21 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  54.34 
 
 		 365 aa  358  6e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  55.19 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  52.09 
 
 		 374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  45.84 
 
 		 376 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  49.73 
 
 		 950 aa  316  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  48.76 
 
 		 950 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  48.36 
 
 		 950 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.8 
 
 		 965 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  43.49 
 
 		 383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  50.28 
 
 		 920 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.83 
 
 		 950 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  47.89 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  47.67 
 
 		 377 aa  306  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  43.28 
 
 		 380 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.38 
 
 		 950 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  42.74 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  48.21 
 
 		 948 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.56 
 
 		 958 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  41.53 
 
 		 388 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  41.16 
 
 		 381 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.23 
 
 		 955 aa  289  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  45.71 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.77 
 
 		 941 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.77 
 
 		 941 aa  286  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.09 
 
 		 940 aa  285  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  47.18 
 
 		 648 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.06 
 
 		 948 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  43.92 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  42.58 
 
 		 365 aa  280  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.7 
 
 		 943 aa  280  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.62 
 
 		 940 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.65 
 
 		 942 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  46.2 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  43.05 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  42.33 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  42.93 
 
 		 368 aa  259  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  38.8 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  40.51 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  39.89 
 
 		 373 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  43.59 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  43.59 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  42.78 
 
 		 357 aa  255  9e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  41.48 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  40.83 
 
 		 1053 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  39.08 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  37.91 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  37.2 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  33.62 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  30.17 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  29.78 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  30.26 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  31.73 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6478  transaldolase  33.78 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  30.55 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  28.49 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  26.07 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  28.62 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  28.62 
 
 		 325 aa  126  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  30.56 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  25.08 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1175  transaldolase  31.89 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  33.97 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  30.1 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>