277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2062 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  100 
 
 
366 aa  736    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  54.57 
 
 
359 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  57.14 
 
 
648 aa  364  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  53.01 
 
 
363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  53.01 
 
 
363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  51.45 
 
 
365 aa  330  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  48.34 
 
 
377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  47.19 
 
 
365 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  43.29 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.01 
 
 
965 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.32 
 
 
958 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  47.56 
 
 
1053 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  47.49 
 
 
373 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.45 
 
 
950 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  45.38 
 
 
368 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.18 
 
 
950 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.53 
 
 
950 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.63 
 
 
950 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  41.24 
 
 
381 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.05 
 
 
950 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  40.7 
 
 
381 aa  287  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.86 
 
 
948 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.98 
 
 
941 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.98 
 
 
941 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  40.11 
 
 
380 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50 
 
 
940 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.9 
 
 
940 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  41.08 
 
 
388 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  43.58 
 
 
368 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  39.35 
 
 
383 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  42.86 
 
 
373 aa  278  8e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  42.23 
 
 
383 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.79 
 
 
942 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  44.29 
 
 
446 aa  276  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  43.06 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.81 
 
 
943 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  42.98 
 
 
371 aa  272  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  41.92 
 
 
920 aa  272  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.33 
 
 
948 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  44.1 
 
 
371 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.11 
 
 
955 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  44.07 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  43.02 
 
 
372 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  43.02 
 
 
372 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  43.02 
 
 
372 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  42.22 
 
 
392 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  44.32 
 
 
381 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  42.13 
 
 
371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  43.26 
 
 
369 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  41.57 
 
 
373 aa  262  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  41.69 
 
 
372 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  41.39 
 
 
371 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  41.99 
 
 
366 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  41.06 
 
 
367 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  41.91 
 
 
368 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  40.34 
 
 
373 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  41.01 
 
 
369 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  41.79 
 
 
372 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  41.41 
 
 
387 aa  255  7e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  40.68 
 
 
373 aa  255  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  40.46 
 
 
368 aa  255  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  41.41 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  41.88 
 
 
371 aa  252  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  40.06 
 
 
370 aa  252  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  40.46 
 
 
367 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  39.89 
 
 
367 aa  251  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  40.56 
 
 
384 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  41.96 
 
 
377 aa  249  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  40.51 
 
 
367 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  40.28 
 
 
371 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  41.11 
 
 
372 aa  246  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  39.66 
 
 
370 aa  245  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  41.14 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  40.17 
 
 
368 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  38.83 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  39.6 
 
 
378 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  37.1 
 
 
376 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  40.88 
 
 
376 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  38.98 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  38.42 
 
 
374 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  40.24 
 
 
383 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  37.86 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  36.44 
 
 
374 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  35.62 
 
 
374 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  34.37 
 
 
326 aa  176  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  33.53 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  32.29 
 
 
334 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  30.68 
 
 
332 aa  146  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  32.18 
 
 
330 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  32.37 
 
 
371 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  29.43 
 
 
325 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  29.14 
 
 
325 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  30 
 
 
331 aa  135  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  29.14 
 
 
325 aa  135  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  31.13 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6478  transaldolase  30.31 
 
 
399 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  27.3 
 
 
323 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1925  transaldolase  27.7 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0587  transaldolase B  32.94 
 
 
327 aa  63.2  0.000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1175  transaldolase  30.9 
 
 
371 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>