90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6478 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6478  transaldolase  100 
 
 		 399 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  35.06 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  35.77 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  37.02 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  34.66 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  34.81 
 
 		 378 aa  199  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  34.1 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  34.36 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  35.16 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  35.16 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  35.16 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  32.81 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  33.59 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  34.32 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  34.92 
 
 		 372 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  34.91 
 
 		 384 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  34.58 
 
 		 369 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  33.95 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  35.22 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  33.07 
 
 		 370 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  34.12 
 
 		 370 aa  186  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  34.11 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  33.08 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  36.86 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  32.36 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  32.63 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  34.01 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  33.16 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  34.15 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  34.16 
 
 		 376 aa  176  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  32.32 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  31.52 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  33.61 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  33.25 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  35.06 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  30.94 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  30.13 
 
 		 365 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  32.35 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  30.3 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  26.26 
 
 		 380 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  29.89 
 
 		 374 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  30.64 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  26.36 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  31.49 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  27.57 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  32.82 
 
 		 648 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  26.99 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  29.75 
 
 		 367 aa  139  8.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  27.22 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  29.59 
 
 		 950 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  28.97 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  30.08 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  27.45 
 
 		 381 aa  125  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.23 
 
 		 965 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  30.08 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  27.08 
 
 		 958 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  26.69 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  26.69 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  30.56 
 
 		 920 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  27.51 
 
 		 950 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.35 
 
 		 950 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  27.39 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  27.81 
 
 		 950 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.75 
 
 		 948 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.59 
 
 		 941 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  27.47 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  27.75 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  25.68 
 
 		 955 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.59 
 
 		 941 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.04 
 
 		 940 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  30.19 
 
 		 1053 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  27.81 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  29.19 
 
 		 948 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.27 
 
 		 940 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  27.01 
 
 		 950 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  25.86 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.49 
 
 		 942 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  26.81 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  24.29 
 
 		 360 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  26.25 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.12 
 
 		 943 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  32.93 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  26.51 
 
 		 368 aa  93.2  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  29.63 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  28.33 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  27.18 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  24.45 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  24.71 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  23.28 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  24.02 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>