More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2975 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  100 
 
 
368 aa  743    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  72.25 
 
 
368 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  68.58 
 
 
367 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  66.3 
 
 
370 aa  484  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  66.48 
 
 
373 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  63.46 
 
 
392 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  61.81 
 
 
392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  64.29 
 
 
373 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  64.36 
 
 
371 aa  465  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  64.75 
 
 
368 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  62.33 
 
 
366 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  62.84 
 
 
372 aa  461  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  62.12 
 
 
371 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  63.74 
 
 
371 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  61.2 
 
 
369 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  63.06 
 
 
372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  63.06 
 
 
372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  63.51 
 
 
373 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  63.06 
 
 
372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  63.46 
 
 
369 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  62.54 
 
 
372 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  61.31 
 
 
373 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  59.83 
 
 
372 aa  438  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  60 
 
 
368 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  59.72 
 
 
378 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  63.41 
 
 
377 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  57.14 
 
 
384 aa  418  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  59.07 
 
 
371 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  58.74 
 
 
370 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  58.79 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  60.89 
 
 
372 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  59.45 
 
 
376 aa  411  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  61.5 
 
 
387 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  61.88 
 
 
367 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  55.83 
 
 
367 aa  402  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  55.56 
 
 
367 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  56.95 
 
 
383 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  55.03 
 
 
371 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  52.35 
 
 
374 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  49.59 
 
 
365 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  50 
 
 
920 aa  322  8e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  48.49 
 
 
377 aa  320  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  47.66 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.79 
 
 
950 aa  311  9e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  42.43 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  45.01 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.01 
 
 
958 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.92 
 
 
965 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.26 
 
 
943 aa  301  9e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  40.79 
 
 
381 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  45.53 
 
 
359 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  41.58 
 
 
381 aa  296  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  40.79 
 
 
380 aa  296  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.51 
 
 
950 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.86 
 
 
950 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.32 
 
 
950 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.05 
 
 
950 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  40.48 
 
 
388 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.79 
 
 
941 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.79 
 
 
941 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.2 
 
 
948 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  43.22 
 
 
365 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.63 
 
 
955 aa  279  6e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.95 
 
 
948 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  47.59 
 
 
381 aa  278  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.51 
 
 
940 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.63 
 
 
940 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  42.86 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  45.35 
 
 
648 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  44.51 
 
 
373 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  41.9 
 
 
368 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  42.7 
 
 
368 aa  262  8e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.78 
 
 
942 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  40.17 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  41.39 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  41.39 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  40.33 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  39.3 
 
 
376 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  42.03 
 
 
361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  41.87 
 
 
357 aa  236  6e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  40.22 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  41.81 
 
 
1053 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  34.88 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  34.25 
 
 
374 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  34.83 
 
 
326 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  32.09 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6478  transaldolase  33.25 
 
 
399 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  31.36 
 
 
331 aa  158  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  29.06 
 
 
332 aa  150  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  30.59 
 
 
330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  31.9 
 
 
331 aa  146  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  30.35 
 
 
371 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  30.81 
 
 
325 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  32.54 
 
 
325 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  32.2 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  30.29 
 
 
346 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  28.05 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1925  transaldolase  31.52 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1175  transaldolase  28.32 
 
 
371 aa  59.7  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1251  transaldolase B  34.33 
 
 
316 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000493372  hitchhiker  0.00916637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>