More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3220 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  100 
 
 		 648 aa  1285    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  56.62 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  57.14 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  57.06 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  56.73 
 
 		 363 aa  362  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  56.73 
 
 		 363 aa  362  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  45.75 
 
 		 376 aa  335  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  54.11 
 
 		 1053 aa  333  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  48.75 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  48.27 
 
 		 965 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  51.38 
 
 		 373 aa  326  9e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50.97 
 
 		 948 aa  323  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.8 
 
 		 950 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.97 
 
 		 950 aa  319  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.53 
 
 		 950 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  49.3 
 
 		 365 aa  317  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.8 
 
 		 950 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50.83 
 
 		 943 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  48.6 
 
 		 372 aa  313  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.75 
 
 		 958 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  51.14 
 
 		 941 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50.84 
 
 		 940 aa  310  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  51.14 
 
 		 941 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  48.07 
 
 		 368 aa  308  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.7 
 
 		 950 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  40.49 
 
 		 383 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  46.96 
 
 		 371 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  40.93 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  42.19 
 
 		 388 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  48.57 
 
 		 372 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  48.57 
 
 		 372 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  48.57 
 
 		 372 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  41.26 
 
 		 381 aa  302  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50.95 
 
 		 942 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  49.44 
 
 		 368 aa  300  7e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  41.8 
 
 		 381 aa  300  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  46.93 
 
 		 370 aa  297  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  46.96 
 
 		 372 aa  297  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.41 
 
 		 955 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.74 
 
 		 948 aa  291  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50.55 
 
 		 940 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2869  tRNA pseudouridine synthase C  59.22 
 
 		 242 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  45.43 
 
 		 373 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  45.33 
 
 		 372 aa  288  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  45.94 
 
 		 367 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  45.18 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  45.2 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  47.08 
 
 		 371 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  45.4 
 
 		 368 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  45.51 
 
 		 371 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  46.4 
 
 		 392 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  47.18 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  46.89 
 
 		 920 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  45.82 
 
 		 392 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  42.82 
 
 		 368 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  44.96 
 
 		 373 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  44.44 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  44.96 
 
 		 367 aa  277  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  48.56 
 
 		 372 aa  277  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  46.22 
 
 		 376 aa  276  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  44.92 
 
 		 369 aa  276  9e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  45.17 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  47.34 
 
 		 381 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  44.92 
 
 		 368 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  46.5 
 
 		 377 aa  273  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  45.35 
 
 		 368 aa  272  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  45.22 
 
 		 369 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  43.93 
 
 		 367 aa  270  7e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  45.09 
 
 		 366 aa  270  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  44.94 
 
 		 373 aa  269  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  45.22 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  41.69 
 
 		 376 aa  267  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  47.42 
 
 		 383 aa  267  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  43.94 
 
 		 371 aa  267  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  44.41 
 
 		 370 aa  264  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  43.38 
 
 		 371 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0267  tRNA pseudouridine synthase C  55.51 
 
 		 270 aa  262  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  44.51 
 
 		 371 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  43.54 
 
 		 361 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3160  RNA pseudouridine synthase family protein  53.49 
 
 		 250 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.466098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  40.82 
 
 		 382 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0611  pseudouridine synthase  49.81 
 
 		 241 aa  254  5.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0279  pseudouridine synthase  48.44 
 
 		 252 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000931063  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  41.6 
 
 		 357 aa  249  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2110  pseudouridine synthase  55.42 
 
 		 245 aa  246  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3184  pseudouridylate synthase  46.48 
 
 		 252 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.575849  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  41.38 
 
 		 374 aa  239  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  39.11 
 
 		 360 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  40.46 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0935  tRNA pseudouridine synthase C  47.08 
 
 		 266 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1546  pseudouridylate synthase  46.33 
 
 		 298 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0713  tRNA pseudouridine synthase C  43.97 
 
 		 263 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3095  tRNA pseudouridine synthase C  45.96 
 
 		 260 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3171  tRNA pseudouridine synthase C  47.47 
 
 		 260 aa  228  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3366  tRNA pseudouridine synthase C  47.08 
 
 		 261 aa  228  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2987  tRNA pseudouridine synthase C  47.86 
 
 		 261 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02636  tRNA pseudouridine synthase  46.69 
 
 		 260 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.908245  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0897  pseudouridine synthase  46.69 
 
 		 260 aa  226  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02598  hypothetical protein  46.69 
 
 		 260 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.908938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3081  tRNA pseudouridine synthase C  46.69 
 
 		 260 aa  226  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.495199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>