More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2074 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  100 
 
 
369 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  79.13 
 
 
371 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  70.49 
 
 
368 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  67.57 
 
 
392 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  66.49 
 
 
392 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  69.27 
 
 
372 aa  498  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  67.57 
 
 
367 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  67.31 
 
 
373 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  64.46 
 
 
366 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  62.33 
 
 
378 aa  467  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  63.04 
 
 
368 aa  461  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  63.66 
 
 
371 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  60.66 
 
 
373 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  60.66 
 
 
372 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  60.66 
 
 
372 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  60.66 
 
 
372 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  59.83 
 
 
371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  61.16 
 
 
373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  61.06 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  61.24 
 
 
384 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  63.46 
 
 
368 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  60.22 
 
 
372 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  61.31 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  61.75 
 
 
367 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  57.97 
 
 
369 aa  435  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  59.02 
 
 
370 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  60.38 
 
 
376 aa  431  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  60.16 
 
 
373 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  58.58 
 
 
371 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  59.95 
 
 
377 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  58.31 
 
 
371 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  56.32 
 
 
368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  56.68 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  57.98 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  54.47 
 
 
367 aa  378  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  55.95 
 
 
383 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  55.28 
 
 
371 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  55.03 
 
 
367 aa  379  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  51.4 
 
 
374 aa  363  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  52.33 
 
 
365 aa  345  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  47.65 
 
 
376 aa  342  8e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.98 
 
 
958 aa  335  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  47.22 
 
 
446 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  48.77 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.98 
 
 
950 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.99 
 
 
950 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.56 
 
 
965 aa  316  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.99 
 
 
955 aa  315  9e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.45 
 
 
950 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.59 
 
 
950 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  42.43 
 
 
388 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.3 
 
 
950 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  42.55 
 
 
383 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  42.43 
 
 
381 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.3 
 
 
948 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  42.97 
 
 
381 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  41.44 
 
 
380 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  48.1 
 
 
943 aa  300  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  47.22 
 
 
920 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  46.89 
 
 
359 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50 
 
 
941 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.91 
 
 
948 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50 
 
 
941 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  48.23 
 
 
942 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  49.15 
 
 
940 aa  289  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  49.18 
 
 
940 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  45.98 
 
 
373 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  44.56 
 
 
383 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  44.26 
 
 
368 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  44.79 
 
 
365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  47.03 
 
 
381 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  45.22 
 
 
648 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  44.66 
 
 
361 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  43.26 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  42.15 
 
 
376 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  43.06 
 
 
363 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  43.06 
 
 
363 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  42.93 
 
 
368 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  42.46 
 
 
357 aa  263  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  42.02 
 
 
382 aa  262  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  42.18 
 
 
1053 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  39.34 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  36.44 
 
 
374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  36.36 
 
 
374 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  34.85 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  33.99 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6478  transaldolase  34.58 
 
 
399 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  29.21 
 
 
334 aa  150  4e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  29.83 
 
 
331 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  30.2 
 
 
332 aa  136  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  29.06 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  31.31 
 
 
325 aa  133  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  30.98 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  30.98 
 
 
325 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  28.65 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  31.62 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  25.93 
 
 
323 aa  100  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1175  transaldolase  30.49 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1251  transaldolase B  34.62 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000493372  hitchhiker  0.00916637 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1925  transaldolase  28.57 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>