More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1981 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  100 
 
 
368 aa  739    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  79.02 
 
 
367 aa  590  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  72.25 
 
 
373 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  66.21 
 
 
368 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  64.85 
 
 
372 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  62.74 
 
 
366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  63.59 
 
 
371 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  62.02 
 
 
373 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  64.75 
 
 
368 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  60.49 
 
 
392 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  63.04 
 
 
369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  61.58 
 
 
371 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  61.71 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  61.85 
 
 
378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  59.4 
 
 
392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  63.09 
 
 
377 aa  441  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  60.93 
 
 
373 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  61.54 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  61.54 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  61.54 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  62.64 
 
 
376 aa  435  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  59.95 
 
 
371 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  60 
 
 
384 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  59.56 
 
 
373 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  59.4 
 
 
370 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  60 
 
 
372 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  57.49 
 
 
372 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  57.65 
 
 
369 aa  418  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  59.83 
 
 
372 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  60.16 
 
 
367 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  57.22 
 
 
371 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  56.68 
 
 
371 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  59.35 
 
 
383 aa  401  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  56.99 
 
 
387 aa  396  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  54.32 
 
 
368 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  54.9 
 
 
374 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  54.47 
 
 
371 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  52.34 
 
 
367 aa  364  1e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  52.62 
 
 
367 aa  363  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  51.91 
 
 
365 aa  345  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  49.59 
 
 
446 aa  331  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  52.19 
 
 
377 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.34 
 
 
958 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  44.72 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  47.78 
 
 
920 aa  300  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  46.24 
 
 
359 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.63 
 
 
955 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  42.28 
 
 
383 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  45.58 
 
 
373 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.78 
 
 
950 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  40.96 
 
 
381 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.84 
 
 
965 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.84 
 
 
950 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  45.14 
 
 
383 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.62 
 
 
943 aa  279  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  40.21 
 
 
380 aa  276  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  42.9 
 
 
365 aa  276  5e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  44.92 
 
 
648 aa  275  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.51 
 
 
948 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  44.2 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  44.2 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.05 
 
 
950 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.19 
 
 
941 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.19 
 
 
941 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.97 
 
 
950 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  45.89 
 
 
381 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  42.74 
 
 
368 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.55 
 
 
950 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  38.83 
 
 
381 aa  268  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.91 
 
 
940 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.52 
 
 
940 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  39.47 
 
 
388 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.2 
 
 
942 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.32 
 
 
948 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  42.86 
 
 
368 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  40.46 
 
 
366 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  41.01 
 
 
357 aa  251  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  41.05 
 
 
382 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  43.59 
 
 
1053 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  40.5 
 
 
376 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  41.03 
 
 
361 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  40.27 
 
 
360 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  35.95 
 
 
374 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  36.36 
 
 
374 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  34.28 
 
 
326 aa  190  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6478  transaldolase  35.98 
 
 
399 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  31.46 
 
 
334 aa  169  6e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  33.91 
 
 
371 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  32.09 
 
 
332 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  31.05 
 
 
331 aa  153  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  31.05 
 
 
331 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  31.18 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  31.18 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  33.78 
 
 
325 aa  145  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  33.45 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  33.16 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  25.63 
 
 
323 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1175  transaldolase  29.49 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1251  transaldolase B  35.14 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000493372  hitchhiker  0.00916637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2706  transaldolase A  33.77 
 
 
316 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>