287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2902 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  100 
 
 		 374 aa  737    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  93.05 
 
 		 374 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  42.23 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.4 
 
 		 950 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  40.32 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.13 
 
 		 950 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.33 
 
 		 950 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  40.69 
 
 		 965 aa  256  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  40.76 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  40.69 
 
 		 950 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  40.27 
 
 		 950 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  36.09 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  37.77 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.57 
 
 		 955 aa  252  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  40.16 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  41.67 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.7 
 
 		 958 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  35.64 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  39.89 
 
 		 920 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  36.36 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  36.27 
 
 		 381 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.63 
 
 		 948 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  40.38 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  41.07 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.58 
 
 		 941 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.58 
 
 		 941 aa  233  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.14 
 
 		 948 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  36.71 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.77 
 
 		 940 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  40.55 
 
 		 365 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.33 
 
 		 940 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  37.5 
 
 		 367 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.68 
 
 		 943 aa  229  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  39.13 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.91 
 
 		 942 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  39.55 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  37.09 
 
 		 368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  36.56 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  38.75 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  39.34 
 
 		 648 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  37.06 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  36.84 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  36.71 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  36.71 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  36.71 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  37.01 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  38.36 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  35.77 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  37.15 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  37.15 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  35.69 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  38.19 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  38.26 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  36.99 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  36.19 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  36.14 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  35.05 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  37.7 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  35.91 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  35.42 
 
 		 371 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  35.54 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  37.98 
 
 		 370 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  35.39 
 
 		 365 aa  205  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  35.07 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  35.36 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  37.57 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  37.77 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  36.91 
 
 		 371 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  36.91 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  33.61 
 
 		 367 aa  202  9e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  34.42 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  35.1 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  35.69 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  34.25 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  39.3 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  34.25 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  34.89 
 
 		 377 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  37.75 
 
 		 1053 aa  196  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  34.6 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  34.52 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  36.49 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  35.42 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  35.93 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  32.68 
 
 		 382 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  27.25 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  26.72 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  24.93 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  25.9 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  25.76 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  30.35 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  24.01 
 
 		 332 aa  123  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  25.62 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  25.35 
 
 		 330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  29.43 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  27.85 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  23.6 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1175  transaldolase  28.96 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1925  transaldolase  28.16 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  36.25 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04593  transaldolase B  41.25 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>