More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1175 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1175  transaldolase  100 
 
 		 371 aa  745    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1925  transaldolase  28.85 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  28.92 
 
 		 648 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  32.21 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  31.95 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  31.76 
 
 		 382 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  29.69 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0519  transaldolase B  29.55 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.882158  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  34.39 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  26.45 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05751  transaldolase B  29.15 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05451  transaldolase B  28.74 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  28.24 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05831  transaldolase B  28.05 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.675554  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  31.2 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1851  transaldolase B  28.16 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  29.38 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  28.47 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05761  transaldolase B  28.16 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  28.91 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  31.4 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.22 
 
 		 958 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  34.44 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  28.44 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  28.44 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  28.44 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  31.46 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  30.51 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1251  transaldolase B  26.45 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000493372  hitchhiker  0.00916637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  28.96 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  31.67 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  26.5 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  26.13 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  32.22 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  34.71 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  29.08 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  24.79 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  25.27 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  30.86 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  23.91 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  26.35 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  28.19 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  29.22 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  32.88 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1834  transaldolase  30.73 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  29.91 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  27.64 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  25.8 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  24.85 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  31.65 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  31.67 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  26.15 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  27.96 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0493  transaldolase B  26.81 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466389  normal  0.164229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  31.25 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  32.48 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  27.36 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05211  transaldolase B  28.34 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  29.82 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  29.65 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  30.49 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0705  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  29.37 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  30.72 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  26.61 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  25.68 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  28.51 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  26.92 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  33.15 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  30.39 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  26.69 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  27.67 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  28.02 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  32.77 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  30.2 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2149  transaldolase A  29.12 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  34.19 
 
 		 943 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  27.57 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  25.32 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  29.13 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  29.49 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  26.72 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  27.41 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  27.35 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  24.69 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  27.31 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  25.73 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  25.73 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  24.69 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  25.73 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  30.06 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  27.67 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  28.19 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  26.89 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  31.84 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  30 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  30 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  28.25 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  26.8 
 
 		 307 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  23.05 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3095  transaldolase B  26.95 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.433626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>