More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0048 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  100 
 
 
365 aa  727    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  50.54 
 
 
376 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  51.08 
 
 
950 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50.41 
 
 
950 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  49.19 
 
 
965 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  49.87 
 
 
948 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50.68 
 
 
950 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  49.2 
 
 
950 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  53.28 
 
 
367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50 
 
 
958 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  53.31 
 
 
377 aa  352  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  50.41 
 
 
950 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  53.41 
 
 
373 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  51.97 
 
 
371 aa  345  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  48.23 
 
 
369 aa  344  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  53.78 
 
 
367 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  49.03 
 
 
446 aa  343  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  45.09 
 
 
388 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  44.41 
 
 
383 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  51.91 
 
 
368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  51.54 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  49.86 
 
 
372 aa  338  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  50.14 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  51.26 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  51.94 
 
 
371 aa  335  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  51.8 
 
 
941 aa  335  9e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  51.8 
 
 
941 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  45.21 
 
 
381 aa  333  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  47.93 
 
 
366 aa  332  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  50.98 
 
 
372 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  50.98 
 
 
372 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  50.98 
 
 
372 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  43.35 
 
 
381 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  51.25 
 
 
387 aa  332  8e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  52.33 
 
 
369 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  50.7 
 
 
392 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.3 
 
 
955 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  50.97 
 
 
373 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  51.25 
 
 
940 aa  329  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  51.32 
 
 
942 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  48.87 
 
 
359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  48.47 
 
 
373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  51.84 
 
 
940 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  49.44 
 
 
368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  49.05 
 
 
373 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  47.92 
 
 
371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  50.41 
 
 
368 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  51.3 
 
 
372 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  41.91 
 
 
380 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  49.16 
 
 
370 aa  322  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  48.19 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  49.6 
 
 
943 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  49.59 
 
 
370 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  51.5 
 
 
381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  46.67 
 
 
367 aa  318  6e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  49.86 
 
 
372 aa  318  7.999999999999999e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  48.61 
 
 
374 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  46.44 
 
 
365 aa  316  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  47.19 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  49.16 
 
 
376 aa  311  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  47.91 
 
 
378 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  46.81 
 
 
371 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  47.86 
 
 
363 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  48.88 
 
 
920 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  46.39 
 
 
384 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  47.86 
 
 
363 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  48.52 
 
 
948 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  49.3 
 
 
648 aa  310  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  44.99 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  49.59 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  44.72 
 
 
367 aa  305  6e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  48.65 
 
 
383 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  46.96 
 
 
371 aa  299  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  48.32 
 
 
377 aa  294  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  41.16 
 
 
376 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  40.88 
 
 
368 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  45.81 
 
 
1053 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  44.82 
 
 
368 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  42.3 
 
 
382 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  41.97 
 
 
361 aa  275  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  42.46 
 
 
357 aa  267  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  40.5 
 
 
360 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  41.55 
 
 
371 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  39.45 
 
 
374 aa  228  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  40.55 
 
 
374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  32.09 
 
 
326 aa  175  9e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  30.95 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  30.48 
 
 
334 aa  171  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  32.57 
 
 
331 aa  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  31.16 
 
 
332 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  30.64 
 
 
330 aa  166  8e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  31.15 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  31.25 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  31.25 
 
 
325 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6478  transaldolase  30.49 
 
 
399 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  28.65 
 
 
325 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  26.42 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1925  transaldolase  26.28 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1175  transaldolase  28.02 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50313  plastidic transaldolase  28.92 
 
 
399 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>